西北农林科技大学学报(自然科学版)
西北農林科技大學學報(自然科學版)
서북농림과기대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF NORTHWEST SCI-TECH UNIVERSITY OF AGRICULTURE AND FORESTRY
2004年
7期
67-71
,共5页
密码子使用偏性%位置依赖%G+C含量
密碼子使用偏性%位置依賴%G+C含量
밀마자사용편성%위치의뢰%G+C함량
对6种双子叶植物、4种单子叶植物、7种多细胞真核动物、2种单细胞真核生物及1种原核生物(大肠杆菌)的编码序列(Coding DNA Sequence,CDS)进行了比较研究.结果发现,各供试物种密码子的用法存在明显的位置依赖,编码区域不同区段对密码子选择使用的程度差异很大,表明基因的同义密码子偏性与其编码区不同区域的碱基环境密切相关;基因组差异是造成密码子使用偏性的首要因素.对"翻译起始区"和"翻译终止区"的特征分析发现,大部分供试物种编码序列中的"翻译起始区"碱基偏置强烈,"翻译终止区"相对较弱,暗示"翻译起始区"的密码子使用对提高蛋白翻译的效率和精确性更为重要.不同物种中G+C含量对其同义密码子偏性的贡献率差异很大,但并非是影响同义密码子使用偏性的唯一因素.可以认为,基因编码区域密码子偏性的研究能为搜寻物种进化的分子机理提供线索.
對6種雙子葉植物、4種單子葉植物、7種多細胞真覈動物、2種單細胞真覈生物及1種原覈生物(大腸桿菌)的編碼序列(Coding DNA Sequence,CDS)進行瞭比較研究.結果髮現,各供試物種密碼子的用法存在明顯的位置依賴,編碼區域不同區段對密碼子選擇使用的程度差異很大,錶明基因的同義密碼子偏性與其編碼區不同區域的堿基環境密切相關;基因組差異是造成密碼子使用偏性的首要因素.對"翻譯起始區"和"翻譯終止區"的特徵分析髮現,大部分供試物種編碼序列中的"翻譯起始區"堿基偏置彊烈,"翻譯終止區"相對較弱,暗示"翻譯起始區"的密碼子使用對提高蛋白翻譯的效率和精確性更為重要.不同物種中G+C含量對其同義密碼子偏性的貢獻率差異很大,但併非是影響同義密碼子使用偏性的唯一因素.可以認為,基因編碼區域密碼子偏性的研究能為搜尋物種進化的分子機理提供線索.
대6충쌍자협식물、4충단자협식물、7충다세포진핵동물、2충단세포진핵생물급1충원핵생물(대장간균)적편마서렬(Coding DNA Sequence,CDS)진행료비교연구.결과발현,각공시물충밀마자적용법존재명현적위치의뢰,편마구역불동구단대밀마자선택사용적정도차이흔대,표명기인적동의밀마자편성여기편마구불동구역적감기배경밀절상관;기인조차이시조성밀마자사용편성적수요인소.대"번역기시구"화"번역종지구"적특정분석발현,대부분공시물충편마서렬중적"번역기시구"감기편치강렬,"번역종지구"상대교약,암시"번역기시구"적밀마자사용대제고단백번역적효솔화정학성경위중요.불동물충중G+C함량대기동의밀마자편성적공헌솔차이흔대,단병비시영향동의밀마자사용편성적유일인소.가이인위,기인편마구역밀마자편성적연구능위수심물충진화적분자궤리제공선색.
