CAJ | 학술논문

利用PCR方法扩增13个猛禽类物种线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇:IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet)、WANCY(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)和HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CCN),测序后结合GenBank已登陆的游隼和普通篱相应序列探讨猛禽类共15种鸟类的分子系统进化.3个目的片段长度分别为212～214 bp、353～362 bp、205～208 bp,通过比较这些tRNA基因序列和二级结构差异,发现可变核苷酸位点占47%,这些变异中67%出现在环区,且存在插入和(或)缺失.茎区相对保守,其中一些变异如双链的互补性碱基突变、G-U配对等对于维系tRNA二级结构的稳定性非常重要.以夜鹰为外群分别构建了15个猛禽类物种共11个线粒体tRNA基因全序列和茎区序列的NJ树和MP树,其中基于全序列的系统发育树分支具有较高的自引导值,因此该数据集所反映的猛禽类系统发育关系可能更接近真实水平.系统发育分析显示,隼形目鹰科更接近于鸱鸮科而不是隼科,而草鸮科的分类地位也与传统的形态学和DNA-DNA杂交数据的结论存在分歧.比较物种间tRNA基因二级结构发现,部分tRNA基因中的核苷酸插入和缺失特征在科水平具有共同衍征,提示这些特征对于猛禽类科间系统发育关系具有较高的参考价值.
이용PCR방법확증13개맹금류물충선립체기인조중3개주요적tRNA기인족:IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet)、WANCY(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)화HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CCN),측서후결합GenBank이등륙적유준화보통리상응서렬탐토맹금류공15충조류적분자계통진화.3개목적편단장도분별위212～214 bp、353～362 bp、205～208 bp,통과비교저사tRNA기인서렬화이급결구차이,발현가변핵감산위점점47%,저사변이중67%출현재배구,차존재삽입화(혹)결실.경구상대보수,기중일사변이여쌍련적호보성감기돌변、G-U배대등대우유계tRNA이급결구적은정성비상중요.이야응위외군분별구건료15개맹금류물충공11개선립체tRNA기인전서렬화경구서렬적NJ수화MP수,기중기우전서렬적계통발육수분지구유교고적자인도치,인차해수거집소반영적맹금류계통발육관계가능경접근진실수평.계통발육분석현시,준형목응과경접근우치효과이불시준과,이초효과적분류지위야여전통적형태학화DNA-DNA잡교수거적결론존재분기.비교물충간tRNA기인이급결구발현,부분tRNA기인중적핵감산삽입화결실특정재과수평구유공동연정,제시저사특정대우맹금류과간계통발육관계구유교고적삼고개치.