畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2012年
5期
826-831
,共6页
孔祥雅%李义%程敏%荆新堂%李勤凡
孔祥雅%李義%程敏%荊新堂%李勤凡
공상아%리의%정민%형신당%리근범
α-甘露糖苷酶%基因克隆%荧光定量PCR%生物信息学%同源建模
α-甘露糖苷酶%基因剋隆%熒光定量PCR%生物信息學%同源建模
α-감로당감매%기인극륭%형광정량PCR%생물신식학%동원건모
本研究旨在对山羊溶酶体α-甘露糖苷酶(α-AMA)基因进行组织表达谱和生物信息学分析.参考牛α-AMA基因序列设计引物,采用PCR技术克隆山羊α-AMA基因序列,并利用荧光定量RT-PCR进行组织表达谱分析以及进行生物信息学预测.首次获得了山羊α-AMA基因,含有完整CDS编码区3000 bp,编码999个氨基酸,其中前50个氨基酸为信号肽序列.其编码区的核苷酸序列和预测氨基酸序列与牛的α-AMA相似性最高,分别为95.93％和94.79％.组织表达谱分析表明α-AMA在山羊各组织均不同程度的表达,其中在肺脏、肝脏、小脑表达量较高.生物信息学预测发现,α-AMA蛋白属于糖苷水解酶38家族成员,有2个保守的结构域,存在9个N-糖基化位点.SWISS-MODEL同源建模山羊α-AMA具有良好的可信度.本研究为探讨酶的作用机理及疯草解毒剂的研制提供了理论依据.
本研究旨在對山羊溶酶體α-甘露糖苷酶(α-AMA)基因進行組織錶達譜和生物信息學分析.參攷牛α-AMA基因序列設計引物,採用PCR技術剋隆山羊α-AMA基因序列,併利用熒光定量RT-PCR進行組織錶達譜分析以及進行生物信息學預測.首次穫得瞭山羊α-AMA基因,含有完整CDS編碼區3000 bp,編碼999箇氨基痠,其中前50箇氨基痠為信號肽序列.其編碼區的覈苷痠序列和預測氨基痠序列與牛的α-AMA相似性最高,分彆為95.93％和94.79％.組織錶達譜分析錶明α-AMA在山羊各組織均不同程度的錶達,其中在肺髒、肝髒、小腦錶達量較高.生物信息學預測髮現,α-AMA蛋白屬于糖苷水解酶38傢族成員,有2箇保守的結構域,存在9箇N-糖基化位點.SWISS-MODEL同源建模山羊α-AMA具有良好的可信度.本研究為探討酶的作用機理及瘋草解毒劑的研製提供瞭理論依據.
본연구지재대산양용매체α-감로당감매(α-AMA)기인진행조직표체보화생물신식학분석.삼고우α-AMA기인서렬설계인물,채용PCR기술극륭산양α-AMA기인서렬,병이용형광정량RT-PCR진행조직표체보분석이급진행생물신식학예측.수차획득료산양α-AMA기인,함유완정CDS편마구3000 bp,편마999개안기산,기중전50개안기산위신호태서렬.기편마구적핵감산서렬화예측안기산서렬여우적α-AMA상사성최고,분별위95.93％화94.79％.조직표체보분석표명α-AMA재산양각조직균불동정도적표체,기중재폐장、간장、소뇌표체량교고.생물신식학예측발현,α-AMA단백속우당감수해매38가족성원,유2개보수적결구역,존재9개N-당기화위점.SWISS-MODEL동원건모산양α-AMA구유량호적가신도.본연구위탐토매적작용궤리급풍초해독제적연제제공료이론의거.
