中华医学杂志
中華醫學雜誌
중화의학잡지
National Medical Journal of China
2006年
10期
681-686
,共6页
边中启%华占楼%严维耀%刘明秋%吴殿源%郑兆鑫
邊中啟%華佔樓%嚴維耀%劉明鞦%吳殿源%鄭兆鑫
변중계%화점루%엄유요%류명추%오전원%정조흠
肝炎病毒,乙型%序列分析%基因型%少数民族
肝炎病毒,乙型%序列分析%基因型%少數民族
간염병독,을형%서렬분석%기인형%소수민족
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基因型在不同民族慢性乙型肝炎(CHB)患者中是否存在进化差异及临床意义.方法应用聚合酶链反应(PCR) 对中国云南少数民族地区50例CHB患者(25例少数民族CHB患者与对照组25例汉族CHB患者)HBV前S2/S(pre S2/S)和C(core,C)基因进行扩增,将PCR扩增产物克隆到载体pBS (pBluescriptⅡSK,pBS)上进行测序分析.结果50例患者HBV preS2/S基因全长846 bp,GC含量占49.1%,编码281个氨基酸(aa);C基因全长552 bp,GC含量占46.1%,编码183个aa.并在GenBank登录注册(AY517619、AY517620、AY517488、AY517489、AY517598、AY517599).通过与GenBank数据库中HBV基因及亚型序列比较,发现全部患者HBV基因与ayw1亚型具有高度同源性,preS2/S基因aa同源性为97.5%～98.6%,C基因aa同源性为94.5%～97.8%.所有患者S基因在"a"抗原决定簇aa第122位为精氨酸(AGA)、第160位为赖氨酸(AAA).发现全部患者HBV基因型均为B型(属ayw1亚型),未发现其他基因型.HBV准种发生频率为4%.25例少数民族CHB患者之间与对照组25例汉族患者之间HBV基因型B差异比较,差异无统计学意义(P＞0.05).所有患者preS2/S基因均存在aa 124精氨酸(R)→赖氨酸(K124)(1.1%)、172亮氨酸(L)→脯氨酸(P172)(1.3%)、306蛋氨酸(M)→苏氨酸(T306)(1.5%)和361异亮氨酸(I)→蛋氨酸(M361)(1.6%)的aa替代,其发生替代的频率>1%.但所有患者发生aa145甘氨酸(G)→精氨酸(R)(0.4%)替代的频率<1%.50例患者C基因在T细胞和B细胞表位存在27～63、80～110、135～153位间aa变异,其中45例患者C基因由于nt 1979A→G,nt 2012T→A,nt 2088G→T,nt2304C→A和nt 2339A→G的变异,分别引起V27、N38、V63、Q135和A147的aa替代,其发生替代的频率>1%.而另外5例重型CHB患者C基因由于nt 2159A→G,nt 2189A→C的变异,分别引起甘氨酸(G87)和亮氨酸(L97)的aa替代.所有患者preS2/S和C基因中未发现碱基的插入或缺失.结论中国云南少数民族地区HBV流行毒株为基因型B(属ayw1亚型,包括发现25个少数民族CHB患者为基因型B),基因型B与不同民族无相关性.HBV病毒载量可作为判定CHB患者预后的重要参数.
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基因型在不同民族慢性乙型肝炎(CHB)患者中是否存在進化差異及臨床意義.方法應用聚閤酶鏈反應(PCR) 對中國雲南少數民族地區50例CHB患者(25例少數民族CHB患者與對照組25例漢族CHB患者)HBV前S2/S(pre S2/S)和C(core,C)基因進行擴增,將PCR擴增產物剋隆到載體pBS (pBluescriptⅡSK,pBS)上進行測序分析.結果50例患者HBV preS2/S基因全長846 bp,GC含量佔49.1%,編碼281箇氨基痠(aa);C基因全長552 bp,GC含量佔46.1%,編碼183箇aa.併在GenBank登錄註冊(AY517619、AY517620、AY517488、AY517489、AY517598、AY517599).通過與GenBank數據庫中HBV基因及亞型序列比較,髮現全部患者HBV基因與ayw1亞型具有高度同源性,preS2/S基因aa同源性為97.5%～98.6%,C基因aa同源性為94.5%～97.8%.所有患者S基因在"a"抗原決定簇aa第122位為精氨痠(AGA)、第160位為賴氨痠(AAA).髮現全部患者HBV基因型均為B型(屬ayw1亞型),未髮現其他基因型.HBV準種髮生頻率為4%.25例少數民族CHB患者之間與對照組25例漢族患者之間HBV基因型B差異比較,差異無統計學意義(P＞0.05).所有患者preS2/S基因均存在aa 124精氨痠(R)→賴氨痠(K124)(1.1%)、172亮氨痠(L)→脯氨痠(P172)(1.3%)、306蛋氨痠(M)→囌氨痠(T306)(1.5%)和361異亮氨痠(I)→蛋氨痠(M361)(1.6%)的aa替代,其髮生替代的頻率>1%.但所有患者髮生aa145甘氨痠(G)→精氨痠(R)(0.4%)替代的頻率<1%.50例患者C基因在T細胞和B細胞錶位存在27～63、80～110、135～153位間aa變異,其中45例患者C基因由于nt 1979A→G,nt 2012T→A,nt 2088G→T,nt2304C→A和nt 2339A→G的變異,分彆引起V27、N38、V63、Q135和A147的aa替代,其髮生替代的頻率>1%.而另外5例重型CHB患者C基因由于nt 2159A→G,nt 2189A→C的變異,分彆引起甘氨痠(G87)和亮氨痠(L97)的aa替代.所有患者preS2/S和C基因中未髮現堿基的插入或缺失.結論中國雲南少數民族地區HBV流行毒株為基因型B(屬ayw1亞型,包括髮現25箇少數民族CHB患者為基因型B),基因型B與不同民族無相關性.HBV病毒載量可作為判定CHB患者預後的重要參數.
목적연구을형간염병독(HBV)기인형재불동민족만성을형간염(CHB)환자중시부존재진화차이급림상의의.방법응용취합매련반응(PCR) 대중국운남소수민족지구50례CHB환자(25례소수민족CHB환자여대조조25례한족CHB환자)HBV전S2/S(pre S2/S)화C(core,C)기인진행확증,장PCR확증산물극륭도재체pBS (pBluescriptⅡSK,pBS)상진행측서분석.결과50례환자HBV preS2/S기인전장846 bp,GC함량점49.1%,편마281개안기산(aa);C기인전장552 bp,GC함량점46.1%,편마183개aa.병재GenBank등록주책(AY517619、AY517620、AY517488、AY517489、AY517598、AY517599).통과여GenBank수거고중HBV기인급아형서렬비교,발현전부환자HBV기인여ayw1아형구유고도동원성,preS2/S기인aa동원성위97.5%～98.6%,C기인aa동원성위94.5%～97.8%.소유환자S기인재"a"항원결정족aa제122위위정안산(AGA)、제160위위뢰안산(AAA).발현전부환자HBV기인형균위B형(속ayw1아형),미발현기타기인형.HBV준충발생빈솔위4%.25례소수민족CHB환자지간여대조조25례한족환자지간HBV기인형B차이비교,차이무통계학의의(P＞0.05).소유환자preS2/S기인균존재aa 124정안산(R)→뢰안산(K124)(1.1%)、172량안산(L)→포안산(P172)(1.3%)、306단안산(M)→소안산(T306)(1.5%)화361이량안산(I)→단안산(M361)(1.6%)적aa체대,기발생체대적빈솔>1%.단소유환자발생aa145감안산(G)→정안산(R)(0.4%)체대적빈솔<1%.50례환자C기인재T세포화B세포표위존재27～63、80～110、135～153위간aa변이,기중45례환자C기인유우nt 1979A→G,nt 2012T→A,nt 2088G→T,nt2304C→A화nt 2339A→G적변이,분별인기V27、N38、V63、Q135화A147적aa체대,기발생체대적빈솔>1%.이령외5례중형CHB환자C기인유우nt 2159A→G,nt 2189A→C적변이,분별인기감안산(G87)화량안산(L97)적aa체대.소유환자preS2/S화C기인중미발현감기적삽입혹결실.결론중국운남소수민족지구HBV류행독주위기인형B(속ayw1아형,포괄발현25개소수민족CHB환자위기인형B),기인형B여불동민족무상관성.HBV병독재량가작위판정CHB환자예후적중요삼수.
