水产科学
水產科學
수산과학
FISHERIES SCIENCE
2011年
9期
551-554
,共4页
胡建华%祖国掌%荣朝振%孙守旗%孙棠丽
鬍建華%祖國掌%榮朝振%孫守旂%孫棠麗
호건화%조국장%영조진%손수기%손당려
大鳞副泥鳅%细胞色素b基因%系统发育
大鱗副泥鰍%細胞色素b基因%繫統髮育
대린부니추%세포색소b기인%계통발육
对15尾大鳞副泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,获得长度为1140 bp的细胞色素b基因同源片断.所有序列中共检测到15种单倍型,序列中共出现81个变异位点,总变异率为7.1％.各单倍型的变异全部是转换或颠换,无插入和缺失,转换／颠换比为6.36.变异位点在3位密码子中的分布呈现偏倚,密码子第3位的变异占总变异的85.18％,而第1和第2位均只占7.41％.A、T、C、G碱基的平均含量分别为27.4％、30.8％、26.5％、15.3％,A+T＞C+G.在所得序列中,密码子第1位上4种碱基使用较为均衡；第2位上碱基T的使用率高达41％,碱基G的使用率低至13.2％；第3位上碱基A的使用率为37.9％,而碱基G的使用率仅为7.0％.以红尾副鳅为外群用邻接法构建分子系统进化树.结果显示,在系统地位上大鳞副泥鳅与黑龙江泥鳅有较近的亲缘关系.
對15尾大鱗副泥鰍的線粒體細胞色素b基因進行PCR擴增和正反測序,穫得長度為1140 bp的細胞色素b基因同源片斷.所有序列中共檢測到15種單倍型,序列中共齣現81箇變異位點,總變異率為7.1％.各單倍型的變異全部是轉換或顛換,無插入和缺失,轉換／顛換比為6.36.變異位點在3位密碼子中的分佈呈現偏倚,密碼子第3位的變異佔總變異的85.18％,而第1和第2位均隻佔7.41％.A、T、C、G堿基的平均含量分彆為27.4％、30.8％、26.5％、15.3％,A+T＞C+G.在所得序列中,密碼子第1位上4種堿基使用較為均衡；第2位上堿基T的使用率高達41％,堿基G的使用率低至13.2％；第3位上堿基A的使用率為37.9％,而堿基G的使用率僅為7.0％.以紅尾副鰍為外群用鄰接法構建分子繫統進化樹.結果顯示,在繫統地位上大鱗副泥鰍與黑龍江泥鰍有較近的親緣關繫.
대15미대린부니추적선립체세포색소b기인진행PCR확증화정반측서,획득장도위1140 bp적세포색소b기인동원편단.소유서렬중공검측도15충단배형,서렬중공출현81개변이위점,총변이솔위7.1％.각단배형적변이전부시전환혹전환,무삽입화결실,전환／전환비위6.36.변이위점재3위밀마자중적분포정현편의,밀마자제3위적변이점총변이적85.18％,이제1화제2위균지점7.41％.A、T、C、G감기적평균함량분별위27.4％、30.8％、26.5％、15.3％,A+T＞C+G.재소득서렬중,밀마자제1위상4충감기사용교위균형；제2위상감기T적사용솔고체41％,감기G적사용솔저지13.2％；제3위상감기A적사용솔위37.9％,이감기G적사용솔부위7.0％.이홍미부추위외군용린접법구건분자계통진화수.결과현시,재계통지위상대린부니추여흑룡강니추유교근적친연관계.
