CAJ | 학술논문

从GenBank中获取多个口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)基因组序列,进行多序列比对之后,设计对应于口蹄疫病毒的3D、VP3和3C区域的引物和探针,分别建立了FMDV群特异性实时荧光RT-PCR、O型特异性实时荧光RT-PCR和Asia Ⅰ型特异性实时荧光RT-PCR检测方法.三种FMDV实时荧光RT-PCR在Lightcycler荧光PCR仪上扩增均出现标准的S型曲线,并且具有良好的特异性,可以很好地将FMDV与传染性牛鼻气管炎病毒(Infectious bovine rhinotmcheitisvirus)、猪传染性胃肠炎病毒(Swine transmissible gastroenteritis virus)、赤羽病病毒(Akabane virus)和猪呼吸系统冠状病毒(Porcine respiratory corona virus)区分.FMDV群特异性实时荧光RT-PCR可以成功扩增O型(O1和O2毒株)和Asia Ⅰ型(Asia Ⅰ 1和Asia Ⅰ 2毒株)FMDV;O型特异性实时荧光RT-PCR可成功扩增O型(O1和O2毒株)FMDV,Asia Ⅰ型(Asia Ⅰ 1和Asia Ⅰ 2毒株)FMDV为阴性;Asia Ⅰ型特异性实时荧光RT-PCR可成功扩增Asia Ⅰ型(Asia Ⅰ 1和Asia Ⅰ 2毒株)FMDV,O型(O1和O2毒株)FMDV为阴性.FMDV群特异性实时荧光RT-PCR、O型特异性实时荧光RT-PCR和Asia Ⅰ型特异性实时荧光RT-PCR都可以检测到10个拷贝的模板,灵敏度接近检测方法的檄限.检测时间短,从加样到反应结束只需要70min.该方法有潜力用于FMDV的实验室筛查与鉴别诊断.
종GenBank중획취다개구제역병독(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)기인조서렬,진행다서렬비대지후,설계대응우구제역병독적3D、VP3화3C구역적인물화탐침,분별건립료FMDV군특이성실시형광RT-PCR、O형특이성실시형광RT-PCR화Asia Ⅰ형특이성실시형광RT-PCR검측방법.삼충FMDV실시형광RT-PCR재Lightcycler형광PCR의상확증균출현표준적S형곡선,병차구유량호적특이성,가이흔호지장FMDV여전염성우비기관염병독(Infectious bovine rhinotmcheitisvirus)、저전염성위장염병독(Swine transmissible gastroenteritis virus)、적우병병독(Akabane virus)화저호흡계통관상병독(Porcine respiratory corona virus)구분.FMDV군특이성실시형광RT-PCR가이성공확증O형(O1화O2독주)화Asia Ⅰ형(Asia Ⅰ 1화Asia Ⅰ 2독주)FMDV;O형특이성실시형광RT-PCR가성공확증O형(O1화O2독주)FMDV,Asia Ⅰ형(Asia Ⅰ 1화Asia Ⅰ 2독주)FMDV위음성;Asia Ⅰ형특이성실시형광RT-PCR가성공확증Asia Ⅰ형(Asia Ⅰ 1화Asia Ⅰ 2독주)FMDV,O형(O1화O2독주)FMDV위음성.FMDV군특이성실시형광RT-PCR、O형특이성실시형광RT-PCR화Asia Ⅰ형특이성실시형광RT-PCR도가이검측도10개고패적모판,령민도접근검측방법적격한.검측시간단,종가양도반응결속지수요70min.해방법유잠력용우FMDV적실험실사사여감별진단.