畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2007年
11期
1230-1234
,共5页
王进产%张龙现%娄飞%宁长申%菅复春%卢庆斌
王進產%張龍現%婁飛%寧長申%菅複春%盧慶斌
왕진산%장룡현%루비%저장신%관복춘%로경빈
隐孢子虫%CPN60%种系发育
隱孢子蟲%CPN60%種繫髮育
은포자충%CPN60%충계발육
本试验以编码线粒体功能性蛋白Chaperonin 60 (CPN60)的核基因作为研究对象,对隐孢子虫分离株CPN60基因进行扩增测序,用Clustal X1.81对扩增序列与GenBank相关参考序列进行比对,然后用PAUP4.0程序中邻接法(Neighbor-joining,NJ)、最大简约法(Parsimony, MP)构建基因树,同时用TREEPUZZLE程序Version 4.1构建最大似然树(Maximum likelihood, ML),以确定不同隐孢子虫虫株之间的进化关系,并以18S rRNA和HSP70基因构建的进化树作参照,评价CPN60是否更适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系的分子标记.结果显示:基于CPN60构建的进化树将隐孢子虫分为两大类:C. baileyi和C. meleagridis处于一个分枝,C. hominis、C. suis、C. parvum牛基因型和C. parvum鼠基因型处于另一个分枝上.不同隐孢子虫之间的同源性介于96%～100%,能有效区分隐孢子虫不同基因型.因此,CPN60基因序列也可作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记.
本試驗以編碼線粒體功能性蛋白Chaperonin 60 (CPN60)的覈基因作為研究對象,對隱孢子蟲分離株CPN60基因進行擴增測序,用Clustal X1.81對擴增序列與GenBank相關參攷序列進行比對,然後用PAUP4.0程序中鄰接法(Neighbor-joining,NJ)、最大簡約法(Parsimony, MP)構建基因樹,同時用TREEPUZZLE程序Version 4.1構建最大似然樹(Maximum likelihood, ML),以確定不同隱孢子蟲蟲株之間的進化關繫,併以18S rRNA和HSP70基因構建的進化樹作參照,評價CPN60是否更適閤作為隱孢子蟲基因分型和進化關繫的分子標記.結果顯示:基于CPN60構建的進化樹將隱孢子蟲分為兩大類:C. baileyi和C. meleagridis處于一箇分枝,C. hominis、C. suis、C. parvum牛基因型和C. parvum鼠基因型處于另一箇分枝上.不同隱孢子蟲之間的同源性介于96%～100%,能有效區分隱孢子蟲不同基因型.因此,CPN60基因序列也可作為隱孢子蟲分離株種繫髮育的遺傳標記.
본시험이편마선립체공능성단백Chaperonin 60 (CPN60)적핵기인작위연구대상,대은포자충분리주CPN60기인진행확증측서,용Clustal X1.81대확증서렬여GenBank상관삼고서렬진행비대,연후용PAUP4.0정서중린접법(Neighbor-joining,NJ)、최대간약법(Parsimony, MP)구건기인수,동시용TREEPUZZLE정서Version 4.1구건최대사연수(Maximum likelihood, ML),이학정불동은포자충충주지간적진화관계,병이18S rRNA화HSP70기인구건적진화수작삼조,평개CPN60시부경괄합작위은포자충기인분형화진화관계적분자표기.결과현시:기우CPN60구건적진화수장은포자충분위량대류:C. baileyi화C. meleagridis처우일개분지,C. hominis、C. suis、C. parvum우기인형화C. parvum서기인형처우령일개분지상.불동은포자충지간적동원성개우96%～100%,능유효구분은포자충불동기인형.인차,CPN60기인서렬야가작위은포자충분리주충계발육적유전표기.
