检验检疫科学
檢驗檢疫科學
검험검역과학
INSPECTION AND QUARANTINE SCIENCE
2007年
1期
10-15
,共6页
龚艳清%彭智发%陈信忠%朱昌福%徐淑菲
龔豔清%彭智髮%陳信忠%硃昌福%徐淑菲
공염청%팽지발%진신충%주창복%서숙비
点带石斑鱼%神经坏死病毒%基因组分析
點帶石斑魚%神經壞死病毒%基因組分析
점대석반어%신경배사병독%기인조분석
[目的]准确诊断发生在福建南部点带石斑鱼育苗场的鱼病.[方法]根据基因库中已报告的石斑鱼NNV核苷酸序列,设计了8对特异性引物,用于扩增点带石斑鱼NNV的RNA1和RNA2特定片段.PCR扩增产物经琼脂糖电泳确认后进行核酸测序,用相应软件进行拼接,得到点带石斑鱼NNV基因组全序列.用DNAstar软件对该序列进行分析,得到相应的氨基酸序列.[结果]该病毒的RNA1含有一个编码依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependant RNA polymerase,RdRp)的开放阅读框(ORF)为2949nt,编码1个由982个氨基酸组成的蛋白质;RNA2的ORF为1017nt,编码1个由338个氨基酸组成的病毒主衣壳蛋白.将这些核苷酸序列以及推导的氨基酸序列与基因库中同属于罗达病毒科(Nodaviridae)的其他罗达病毒进行同源性比较,该病毒与其他已知的石斑鱼NNV的同源性高.系统发育进化分析也表明,点带石斑鱼NNV与其他石斑鱼NNV亲缘关系很近,同属于赤点石斑NNV血清群,与其他β罗达病毒有一定的距离,与α罗达病毒则有明显的不同.[结论]福建南部个别点带石斑鱼育苗场的石斑鱼感染了神经坏死病毒.
[目的]準確診斷髮生在福建南部點帶石斑魚育苗場的魚病.[方法]根據基因庫中已報告的石斑魚NNV覈苷痠序列,設計瞭8對特異性引物,用于擴增點帶石斑魚NNV的RNA1和RNA2特定片段.PCR擴增產物經瓊脂糖電泳確認後進行覈痠測序,用相應軟件進行拼接,得到點帶石斑魚NNV基因組全序列.用DNAstar軟件對該序列進行分析,得到相應的氨基痠序列.[結果]該病毒的RNA1含有一箇編碼依賴RNA的RNA聚閤酶(RNA-dependant RNA polymerase,RdRp)的開放閱讀框(ORF)為2949nt,編碼1箇由982箇氨基痠組成的蛋白質;RNA2的ORF為1017nt,編碼1箇由338箇氨基痠組成的病毒主衣殼蛋白.將這些覈苷痠序列以及推導的氨基痠序列與基因庫中同屬于囉達病毒科(Nodaviridae)的其他囉達病毒進行同源性比較,該病毒與其他已知的石斑魚NNV的同源性高.繫統髮育進化分析也錶明,點帶石斑魚NNV與其他石斑魚NNV親緣關繫很近,同屬于赤點石斑NNV血清群,與其他β囉達病毒有一定的距離,與α囉達病毒則有明顯的不同.[結論]福建南部箇彆點帶石斑魚育苗場的石斑魚感染瞭神經壞死病毒.
[목적]준학진단발생재복건남부점대석반어육묘장적어병.[방법]근거기인고중이보고적석반어NNV핵감산서렬,설계료8대특이성인물,용우확증점대석반어NNV적RNA1화RNA2특정편단.PCR확증산물경경지당전영학인후진행핵산측서,용상응연건진행병접,득도점대석반어NNV기인조전서렬.용DNAstar연건대해서렬진행분석,득도상응적안기산서렬.[결과]해병독적RNA1함유일개편마의뢰RNA적RNA취합매(RNA-dependant RNA polymerase,RdRp)적개방열독광(ORF)위2949nt,편마1개유982개안기산조성적단백질;RNA2적ORF위1017nt,편마1개유338개안기산조성적병독주의각단백.장저사핵감산서렬이급추도적안기산서렬여기인고중동속우라체병독과(Nodaviridae)적기타라체병독진행동원성비교,해병독여기타이지적석반어NNV적동원성고.계통발육진화분석야표명,점대석반어NNV여기타석반어NNV친연관계흔근,동속우적점석반NNV혈청군,여기타β라체병독유일정적거리,여α라체병독칙유명현적불동.[결론]복건남부개별점대석반어육묘장적석반어감염료신경배사병독.