动物分类学报
動物分類學報
동물분류학보
ACTA ZOOTAXONOMICA SINICA
2001年
4期
440-447
,共8页
系统树%mtDNA%拓扑距离%建树方法
繫統樹%mtDNA%拓撲距離%建樹方法
계통수%mtDNA%탁복거리%건수방법
给出了一种新的系统树间的拓扑距离.使用NJ、MP、UPGMA等3种方法对13种动物的线粒体中14个基因(含组合的)DNA序列数据进行系统树的构建.利用分割拓扑距离和本文给出的通经拓扑距离对这14种系统树之间及其与真树进行比较.结果显示,NJ法对获得已知树的有效率最高,MP法次之,UPGMA法最低.这14种DNA序列所构建的系统树与已知树的拓扑距离基本上是随其DNA序列长度增加而减小,但两者的相关系数并未达到显著水平.分割拓扑距离在总体上可反映树间的拓扑结构差异,但其测度精确度比通经拓扑距离要低.
給齣瞭一種新的繫統樹間的拓撲距離.使用NJ、MP、UPGMA等3種方法對13種動物的線粒體中14箇基因(含組閤的)DNA序列數據進行繫統樹的構建.利用分割拓撲距離和本文給齣的通經拓撲距離對這14種繫統樹之間及其與真樹進行比較.結果顯示,NJ法對穫得已知樹的有效率最高,MP法次之,UPGMA法最低.這14種DNA序列所構建的繫統樹與已知樹的拓撲距離基本上是隨其DNA序列長度增加而減小,但兩者的相關繫數併未達到顯著水平.分割拓撲距離在總體上可反映樹間的拓撲結構差異,但其測度精確度比通經拓撲距離要低.
급출료일충신적계통수간적탁복거리.사용NJ、MP、UPGMA등3충방법대13충동물적선립체중14개기인(함조합적)DNA서렬수거진행계통수적구건.이용분할탁복거리화본문급출적통경탁복거리대저14충계통수지간급기여진수진행비교.결과현시,NJ법대획득이지수적유효솔최고,MP법차지,UPGMA법최저.저14충DNA서렬소구건적계통수여이지수적탁복거리기본상시수기DNA서렬장도증가이감소,단량자적상관계수병미체도현저수평.분할탁복거리재총체상가반영수간적탁복결구차이,단기측도정학도비통경탁복거리요저.
