CAJ | 학술논문

为了验证作者建立的葡萄(Vitis vinifera L.)基因电子表达分析平台在葡萄果实发育相关基因的表达预测及特定序列快速检索等方面的应用效果,利用NCBI上公布的大量葡萄EST序列及半定量PCR和RT-PCR技术,对葡萄不同器官中VvANR、VvCHI、VvCHS2和VvDFR基因的表达分析预测结果进行验证,并对该平台具有的特定序列快速检索功能进行了简介.预测结果表明:葡萄各器官中VvANR、VvCHI、VvCHS2和VvDFR基因的无冗余EST序列数量均较多,分别为33条、36条、55条和46条；4个基因的表达量有一定差异,VvANR在花序和芽中表达量较高,VvCHI在花序、果实和芽中表达量较高,VvCHS2在果实、芽、花序和花中表达量较高,VvDFR在花序、芽、花、果实和根中表达量均较高.半定量PCR和RT-PCR实验结果显示:VvANR主要在花序、花和小果中表达；VvCHI主要在小果、花、茎和花序中表达；VvCHS2主要在茎、花序、花和小果中表达；VvDFR在各组织中表达量从高至低依次排序为花、花序、茎、叶、小果、中果、大果.验证结果表明:采用葡萄基因电子表达分析平台识别表达量较高的组织时,平台的预测结果与实验结果基本一致；而在预测一些表达量较低的组织时效果较差.应用该平台、通过5个步骤,可以简便、快速检索出特定组织或特定状况下的特定cDNA文库信息.
위료험증작자건립적포도(Vitis vinifera L.)기인전자표체분석평태재포도과실발육상관기인적표체예측급특정서렬쾌속검색등방면적응용효과,이용NCBI상공포적대량포도EST서렬급반정량PCR화RT-PCR기술,대포도불동기관중VvANR、VvCHI、VvCHS2화VvDFR기인적표체분석예측결과진행험증,병대해평태구유적특정서렬쾌속검색공능진행료간개.예측결과표명:포도각기관중VvANR、VvCHI、VvCHS2화VvDFR기인적무용여EST서렬수량균교다,분별위33조、36조、55조화46조；4개기인적표체량유일정차이,VvANR재화서화아중표체량교고,VvCHI재화서、과실화아중표체량교고,VvCHS2재과실、아、화서화화중표체량교고,VvDFR재화서、아、화、과실화근중표체량균교고.반정량PCR화RT-PCR실험결과현시:VvANR주요재화서、화화소과중표체；VvCHI주요재소과、화、경화화서중표체；VvCHS2주요재경、화서、화화소과중표체；VvDFR재각조직중표체량종고지저의차배서위화、화서、경、협、소과、중과、대과.험증결과표명:채용포도기인전자표체분석평태식별표체량교고적조직시,평태적예측결과여실험결과기본일치；이재예측일사표체량교저적조직시효과교차.응용해평태、통과5개보취,가이간편、쾌속검색출특정조직혹특정상황하적특정cDNA문고신식.