中国生物医学工程学报
中國生物醫學工程學報
중국생물의학공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING
2012年
3期
422-427
,共6页
熊邦书%陈乐平%欧巧凤%张超
熊邦書%陳樂平%歐巧鳳%張超
웅방서%진악평%구교봉%장초
凝胶图像%蛋白点匹配%分层策略%灰度相关%几何相关
凝膠圖像%蛋白點匹配%分層策略%灰度相關%幾何相關
응효도상%단백점필배%분층책략%회도상관%궤하상관
凝胶图像间蛋白点比对分析是蛋白质组学研究的重要方法,针对凝胶图像间蛋白点人工比对工作量大和易出错等问题,提出一种基于分层策略的凝胶图像间蛋白点自动匹配算法.首先将每张凝胶图像中的蛋白点按不同灰度等级划分到对应层级中;然后根据蛋白点的灰度相关性,采用归一化互相关法对各层级蛋白点进行粗匹配;最后以粗匹配蛋白点点对作为标记特征点,采用几何相关法和相似性准则,实现蛋白点间的精确匹配.通过对国际凝胶图和Bio-Rad公司测试图等不同图源的凝胶图像进行蛋白点匹配实验,结果表明,该算法具有较高的匹配精度,其匹配误差小于4%,对不同来源和不同图像形变的凝胶图像都具有较好的稳定性.
凝膠圖像間蛋白點比對分析是蛋白質組學研究的重要方法,針對凝膠圖像間蛋白點人工比對工作量大和易齣錯等問題,提齣一種基于分層策略的凝膠圖像間蛋白點自動匹配算法.首先將每張凝膠圖像中的蛋白點按不同灰度等級劃分到對應層級中;然後根據蛋白點的灰度相關性,採用歸一化互相關法對各層級蛋白點進行粗匹配;最後以粗匹配蛋白點點對作為標記特徵點,採用幾何相關法和相似性準則,實現蛋白點間的精確匹配.通過對國際凝膠圖和Bio-Rad公司測試圖等不同圖源的凝膠圖像進行蛋白點匹配實驗,結果錶明,該算法具有較高的匹配精度,其匹配誤差小于4%,對不同來源和不同圖像形變的凝膠圖像都具有較好的穩定性.
응효도상간단백점비대분석시단백질조학연구적중요방법,침대응효도상간단백점인공비대공작량대화역출착등문제,제출일충기우분층책략적응효도상간단백점자동필배산법.수선장매장응효도상중적단백점안불동회도등급화분도대응층급중;연후근거단백점적회도상관성,채용귀일화호상관법대각층급단백점진행조필배;최후이조필배단백점점대작위표기특정점,채용궤하상관법화상사성준칙,실현단백점간적정학필배.통과대국제응효도화Bio-Rad공사측시도등불동도원적응효도상진행단백점필배실험,결과표명,해산법구유교고적필배정도,기필배오차소우4%,대불동래원화불동도상형변적응효도상도구유교호적은정성.