物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2012年
3期
541-546
,共6页
张庆友%龙海林%冯秀林%索净洁%张丹丹%李静亚%许力壮%许禄
張慶友%龍海林%馮秀林%索淨潔%張丹丹%李靜亞%許力壯%許祿
장경우%룡해림%풍수림%색정길%장단단%리정아%허력장%허록
分子映射指数%Kohonen自组织映射%随机森林%诱变性%结构-活性关系
分子映射指數%Kohonen自組織映射%隨機森林%誘變性%結構-活性關繫
분자영사지수%Kohonen자조직영사%수궤삼림%유변성%결구-활성관계
分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果:2305个结构有诱变性,1770个结构无诱变性)的变异性预测.通过随机森林,分别采用三种类型的指数建立模型:(1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合.整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4％.为了检验模型的稳定性,采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物,正确预测率为86.7％,与此前的研究相比,两个预测结果均有所提高.
分子映射(MOLMAP)指數是以分子的化學鍵描述符為基礎,通過Kohonen自組織映射依據一定的算法而衍生.化學鍵描述符是由化學鍵的物理化學性質,如兩耑原子的電荷差和拓撲性質,鍵連雜原子數量等所組成.本文將分子映射指數應用于4075箇有機物質(Ames實驗結果:2305箇結構有誘變性,1770箇結構無誘變性)的變異性預測.通過隨機森林,分彆採用三種類型的指數建立模型:(1)採用不同維數的分子映射指數;(2)採用全跼分子描述符;(3)將分子映射指數與全跼分子描述符相結閤.整箇數據集的集外(out-of-bag)交扠驗證的正確預測率達到85.4％.為瞭檢驗模型的穩定性,採用所建模型預測源于另一數據庫的472箇化閤物,正確預測率為86.7％,與此前的研究相比,兩箇預測結果均有所提高.
분자영사(MOLMAP)지수시이분자적화학건묘술부위기출,통과Kohonen자조직영사의거일정적산법이연생.화학건묘술부시유화학건적물이화학성질,여량단원자적전하차화탁복성질,건련잡원자수량등소조성.본문장분자영사지수응용우4075개유궤물질(Ames실험결과:2305개결구유유변성,1770개결구무유변성)적변이성예측.통과수궤삼림,분별채용삼충류형적지수건립모형:(1)채용불동유수적분자영사지수;(2)채용전국분자묘술부;(3)장분자영사지수여전국분자묘술부상결합.정개수거집적집외(out-of-bag)교차험증적정학예측솔체도85.4％.위료검험모형적은정성,채용소건모형예측원우령일수거고적472개화합물,정학예측솔위86.7％,여차전적연구상비,량개예측결과균유소제고.
