安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
27期
13238-13242
,共5页
PIN家族%水稻%生物信息学
PIN傢族%水稻%生物信息學
PIN가족%수도%생물신식학
作为植物中最重要的生长素外输载体,PIN家族在各种植物中都拥有众多成员.对水稻基因组的BLAST搜索获得了12个PIN家族成员,分析发现:水稻PIN基因不均衡地分布在基因组染色体上;其内含子、外显子结构类似;PIN蛋白质拥有典型的载体蛋白序列特征,即亲/疏水性反复变化,存在多次跨膜结构域;几乎所有PIN蛋白都有一个NPNXY的内化结构域和7个功能未知的基序;PIN在早期即分化为两组成员,主要区别在于中间亲水环的部分缺失;并且在后来发生了支系特异的复制事件,从而形成了众多旁系同源基因.
作為植物中最重要的生長素外輸載體,PIN傢族在各種植物中都擁有衆多成員.對水稻基因組的BLAST搜索穫得瞭12箇PIN傢族成員,分析髮現:水稻PIN基因不均衡地分佈在基因組染色體上;其內含子、外顯子結構類似;PIN蛋白質擁有典型的載體蛋白序列特徵,即親/疏水性反複變化,存在多次跨膜結構域;幾乎所有PIN蛋白都有一箇NPNXY的內化結構域和7箇功能未知的基序;PIN在早期即分化為兩組成員,主要區彆在于中間親水環的部分缺失;併且在後來髮生瞭支繫特異的複製事件,從而形成瞭衆多徬繫同源基因.
작위식물중최중요적생장소외수재체,PIN가족재각충식물중도옹유음다성원.대수도기인조적BLAST수색획득료12개PIN가족성원,분석발현:수도PIN기인불균형지분포재기인조염색체상;기내함자、외현자결구유사;PIN단백질옹유전형적재체단백서렬특정,즉친/소수성반복변화,존재다차과막결구역;궤호소유PIN단백도유일개NPNXY적내화결구역화7개공능미지적기서;PIN재조기즉분화위량조성원,주요구별재우중간친수배적부분결실;병차재후래발생료지계특이적복제사건,종이형성료음다방계동원기인.