农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2004年
5期
493-499
,共7页
uORF%uATG%植物%统计分析
uORF%uATG%植物%統計分析
uORF%uATG%식물%통계분석
真核生物mRNA 5'非编码区上游可译框(uORF)在基因翻译水平上的调控具有重要作用.对植物2 200多个cDNA序列5'非编码区的uATG和uORF进行统计分析,结果表明,含uATG的基因高达18%,这一比例比估计的10%要高得多,其中含单个uATG的基因约占50%,含2个uATG的基因占20%左右;大部分uORF属于非交叉uORF,约占85%;编码1～5氨基酸的uORF占30%以上,大部分uORF编码多肽小于20个氨基酸,占77.6%;mRNA ORF起始密码子ATG的两边序列有显著的偏爱性,与植物共有序列UAAACAAUGGCU或AACAAUGGC基本一致,但有uATG的mRNA ORF起始密码子ATG的两边序列比不含uATG的mRNA ORF起始密码子ATG的两边序列偏爱性要差.大多数uATG两边序列缺乏植物ORF起始密码子ATG的两边序列的偏爱性.不同种属mRNA5'非编码区uORF氨基酸并不具有显著的同源性,如果植物S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶等少数基因具有非常保守的uORF,氨基酸序列同源性高达75%～100%,显著高于植物S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶之间的同源性.
真覈生物mRNA 5'非編碼區上遊可譯框(uORF)在基因翻譯水平上的調控具有重要作用.對植物2 200多箇cDNA序列5'非編碼區的uATG和uORF進行統計分析,結果錶明,含uATG的基因高達18%,這一比例比估計的10%要高得多,其中含單箇uATG的基因約佔50%,含2箇uATG的基因佔20%左右;大部分uORF屬于非交扠uORF,約佔85%;編碼1～5氨基痠的uORF佔30%以上,大部分uORF編碼多肽小于20箇氨基痠,佔77.6%;mRNA ORF起始密碼子ATG的兩邊序列有顯著的偏愛性,與植物共有序列UAAACAAUGGCU或AACAAUGGC基本一緻,但有uATG的mRNA ORF起始密碼子ATG的兩邊序列比不含uATG的mRNA ORF起始密碼子ATG的兩邊序列偏愛性要差.大多數uATG兩邊序列缺乏植物ORF起始密碼子ATG的兩邊序列的偏愛性.不同種屬mRNA5'非編碼區uORF氨基痠併不具有顯著的同源性,如果植物S-腺苷甲硫氨痠脫羧酶等少數基因具有非常保守的uORF,氨基痠序列同源性高達75%～100%,顯著高于植物S-腺苷甲硫氨痠脫羧酶之間的同源性.
진핵생물mRNA 5'비편마구상유가역광(uORF)재기인번역수평상적조공구유중요작용.대식물2 200다개cDNA서렬5'비편마구적uATG화uORF진행통계분석,결과표명,함uATG적기인고체18%,저일비례비고계적10%요고득다,기중함단개uATG적기인약점50%,함2개uATG적기인점20%좌우;대부분uORF속우비교차uORF,약점85%;편마1～5안기산적uORF점30%이상,대부분uORF편마다태소우20개안기산,점77.6%;mRNA ORF기시밀마자ATG적량변서렬유현저적편애성,여식물공유서렬UAAACAAUGGCU혹AACAAUGGC기본일치,단유uATG적mRNA ORF기시밀마자ATG적량변서렬비불함uATG적mRNA ORF기시밀마자ATG적량변서렬편애성요차.대다수uATG량변서렬결핍식물ORF기시밀마자ATG적량변서렬적편애성.불동충속mRNA5'비편마구uORF안기산병불구유현저적동원성,여과식물S-선감갑류안산탈최매등소수기인구유비상보수적uORF,안기산서렬동원성고체75%～100%,현저고우식물S-선감갑류안산탈최매지간적동원성.
