微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2008年
10期
1295-1300
,共6页
游动双孢菌%线型质粒%全序列%端粒%复制
遊動雙孢菌%線型質粒%全序列%耑粒%複製
유동쌍포균%선형질립%전서렬%단립%복제
[目的]获得游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列,并揭示新型的端粒复制蛋白和可能的中间复制位点.[方法]用分段克隆的方法和序列拼接获得pPR2的全序列,利用软件分析端粒DNA的二级结构和可能的端粒复制蛋白,利用链霉菌原生质体转化的方法检测可能的中间复制的位点.[结果]pPR2全长为15520 bp,(G+C)含量为68.1%.其端粒末端反向重复序列的长度为329 bp,不能像多数链霉菌的线型质粒那样能形成保守的"折返"的二级结构.pPR2虽然没有参与链霉菌端粒复制的保守的tap/tpg基因,但是pPR2.3c基因编码了一个双结构域蛋白,分别同链霉菌的端粒复制相关蛋白Tap和嗜血杆菌的解旋酶具有相似性.pPR2缺少典型的链霉菌重复序列-复制基因(iteron-rep)区段,将几乎覆盖全长pPR2的两段DNA进行克隆后,不能转化变铅青链霉菌.此外,pPR2基因还编码可能参与线型DNA复制的调控的单链结合蛋白(SSB)和与放线菌质粒接合转移相关的主要蛋白(Tva).[结论]pPR2是链霉菌之外的放线菌中最小的线型质粒,其序列在游动双孢菌属的线型质粒中是首次报道.pPR2可能具有新型的端粒复制的机制,其中pPR2.2c和pPR2.3c编码可能的端粒复制蛋白.
[目的]穫得遊動雙孢菌線型質粒pPR2的全序列,併揭示新型的耑粒複製蛋白和可能的中間複製位點.[方法]用分段剋隆的方法和序列拼接穫得pPR2的全序列,利用軟件分析耑粒DNA的二級結構和可能的耑粒複製蛋白,利用鏈黴菌原生質體轉化的方法檢測可能的中間複製的位點.[結果]pPR2全長為15520 bp,(G+C)含量為68.1%.其耑粒末耑反嚮重複序列的長度為329 bp,不能像多數鏈黴菌的線型質粒那樣能形成保守的"摺返"的二級結構.pPR2雖然沒有參與鏈黴菌耑粒複製的保守的tap/tpg基因,但是pPR2.3c基因編碼瞭一箇雙結構域蛋白,分彆同鏈黴菌的耑粒複製相關蛋白Tap和嗜血桿菌的解鏇酶具有相似性.pPR2缺少典型的鏈黴菌重複序列-複製基因(iteron-rep)區段,將幾乎覆蓋全長pPR2的兩段DNA進行剋隆後,不能轉化變鉛青鏈黴菌.此外,pPR2基因還編碼可能參與線型DNA複製的調控的單鏈結閤蛋白(SSB)和與放線菌質粒接閤轉移相關的主要蛋白(Tva).[結論]pPR2是鏈黴菌之外的放線菌中最小的線型質粒,其序列在遊動雙孢菌屬的線型質粒中是首次報道.pPR2可能具有新型的耑粒複製的機製,其中pPR2.2c和pPR2.3c編碼可能的耑粒複製蛋白.
[목적]획득유동쌍포균선형질립pPR2적전서렬,병게시신형적단립복제단백화가능적중간복제위점.[방법]용분단극륭적방법화서렬병접획득pPR2적전서렬,이용연건분석단립DNA적이급결구화가능적단립복제단백,이용련매균원생질체전화적방법검측가능적중간복제적위점.[결과]pPR2전장위15520 bp,(G+C)함량위68.1%.기단립말단반향중복서렬적장도위329 bp,불능상다수련매균적선형질립나양능형성보수적"절반"적이급결구.pPR2수연몰유삼여련매균단립복제적보수적tap/tpg기인,단시pPR2.3c기인편마료일개쌍결구역단백,분별동련매균적단립복제상관단백Tap화기혈간균적해선매구유상사성.pPR2결소전형적련매균중복서렬-복제기인(iteron-rep)구단,장궤호복개전장pPR2적량단DNA진행극륭후,불능전화변연청련매균.차외,pPR2기인환편마가능삼여선형DNA복제적조공적단련결합단백(SSB)화여방선균질립접합전이상관적주요단백(Tva).[결론]pPR2시련매균지외적방선균중최소적선형질립,기서렬재유동쌍포균속적선형질립중시수차보도.pPR2가능구유신형적단립복제적궤제,기중pPR2.2c화pPR2.3c편마가능적단립복제단백.