CAJ | 학술논문

为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析,进行了南瓜EST-SSR标记的开发.从NCBI数据库下载1 457条南瓜属作物EST序列,去除冗余序列后进行SSR位点搜索,共得到215条含有SSR位点的EST序列.这些SSR位点包含111种重复基元,其中二核苷酸(62个,占28.84％)和三核苷酸(86个,占40.0％)重复类型占主导地位；重复基元中出现最多的是CT(21个,占9.77％),其次为TC(13个,占6.05％)和AAG(12个,占5.58％).将215个SSR位点设计成EST-SSR引物后,随机合成了其中的43对引物.利用4份遗传背景差异较大的南瓜自交系对合成的43对引物进行扩增效果评价,其中28对引物有稳定清晰的扩增产物,占合成引物的65.12％.利用这些有效扩增引物对南瓜属作物商品杂交种进行纯度检测,共获得13个杂交组合的特异性检测引物,F1杂交种的纯度在79.2％～ 100.0％,与田间检测结果相符.结果表明,利用南瓜EST序列开发SSR引物具有简单快速、成本低和适用性好的特点.
위이용SSR표기진행쾌속、준학적남과잡교충순도분석,진행료남과EST-SSR표기적개발.종NCBI수거고하재1 457조남과속작물EST서렬,거제용여서렬후진행SSR위점수색,공득도215조함유SSR위점적EST서렬.저사SSR위점포함111충중복기원,기중이핵감산(62개,점28.84％)화삼핵감산(86개,점40.0％)중복류형점주도지위；중복기원중출현최다적시CT(21개,점9.77％),기차위TC(13개,점6.05％)화AAG(12개,점5.58％).장215개SSR위점설계성EST-SSR인물후,수궤합성료기중적43대인물.이용4빈유전배경차이교대적남과자교계대합성적43대인물진행확증효과평개,기중28대인물유은정청석적확증산물,점합성인물적65.12％.이용저사유효확증인물대남과속작물상품잡교충진행순도검측,공획득13개잡교조합적특이성검측인물,F1잡교충적순도재79.2％～ 100.0％,여전간검측결과상부.결과표명,이용남과EST서렬개발SSR인물구유간단쾌속、성본저화괄용성호적특점.