生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2012年
3期
104-110
,共7页
张国俊%胡利宗%李书粉%宋向凤
張國俊%鬍利宗%李書粉%宋嚮鳳
장국준%호리종%리서분%송향봉
哺乳动物%抗凝血酶%微共线性%保守基序%进化
哺乳動物%抗凝血酶%微共線性%保守基序%進化
포유동물%항응혈매%미공선성%보수기서%진화
抗凝血酶(AT)是哺乳动物体内重要的天然抗凝血因子之一,它隶属于丝氨酸蛋白酶抑制物家族,主要参与并调节复杂的血凝过程.基于比较基因组学手段,共挖掘出17个哺乳动物抗凝血酶基因(AT),并剖析了它们的基因结构、微共线性、保守基序、功能结构域、以及系统进化关系.基因结构与微共线分析表明,哺乳动物AT基因具有5-12个外显子,大多数是7个外显子;不同物种AT基因所处区段之间具有较好的共线性.哺乳动物AT蛋白特征分析显示,SERPIN功能结构域与保守基序1、2、3、4、5、8和9存在相互重叠的部分.AT基因进化树揭示基因进化和通常认为的物种进化几乎一致.同时,利用PAML中Codeml的位点特异模型在AT基因中发掘了1个正选择位点328D.
抗凝血酶(AT)是哺乳動物體內重要的天然抗凝血因子之一,它隸屬于絲氨痠蛋白酶抑製物傢族,主要參與併調節複雜的血凝過程.基于比較基因組學手段,共挖掘齣17箇哺乳動物抗凝血酶基因(AT),併剖析瞭它們的基因結構、微共線性、保守基序、功能結構域、以及繫統進化關繫.基因結構與微共線分析錶明,哺乳動物AT基因具有5-12箇外顯子,大多數是7箇外顯子;不同物種AT基因所處區段之間具有較好的共線性.哺乳動物AT蛋白特徵分析顯示,SERPIN功能結構域與保守基序1、2、3、4、5、8和9存在相互重疊的部分.AT基因進化樹揭示基因進化和通常認為的物種進化幾乎一緻.同時,利用PAML中Codeml的位點特異模型在AT基因中髮掘瞭1箇正選擇位點328D.
항응혈매(AT)시포유동물체내중요적천연항응혈인자지일,타대속우사안산단백매억제물가족,주요삼여병조절복잡적혈응과정.기우비교기인조학수단,공알굴출17개포유동물항응혈매기인(AT),병부석료타문적기인결구、미공선성、보수기서、공능결구역、이급계통진화관계.기인결구여미공선분석표명,포유동물AT기인구유5-12개외현자,대다수시7개외현자;불동물충AT기인소처구단지간구유교호적공선성.포유동물AT단백특정분석현시,SERPIN공능결구역여보수기서1、2、3、4、5、8화9존재상호중첩적부분.AT기인진화수게시기인진화화통상인위적물충진화궤호일치.동시,이용PAML중Codeml적위점특이모형재AT기인중발굴료1개정선택위점328D.