CAJ | 학술논문

对31308条来自NCBI的芭蕉属(Musa)EST序列进行拼接得到全长为13.51 Mb的21 129条无冗余EST序列(含3 818条contigs及17 311条singletons),其中,4 944条(23.40％)EST序列含有5 416条SSRs,SSR的出现频率为25.63％,平均分布距离2.49 Kb,有234条(1.11％)含有1个以上的SSR.在所检测的SSR中,二、三、四核苷酸重复是主导重复类型,分别占EST-SSR总数的21.80％(1 181条)、52.55％ (2 846条)和14.55％(788条).AG/CT、AAG/CTT与AGG/CCT和AAAG/CTTT与AAAT/ATTT分别是二、三、四核苷酸的优势重复基元.随机设计了238对EST-SSR引物在24个地涌金莲个体中进行筛选,116对有扩增产物,其中,78对EST-SSR弓物扩增出清晰稳定的目的片段,49对引物表现出多态性.本研究检测的15对引物扩增等位基因数范围是2～7个,平均3.067个；表观杂合度(Ho)范围是0.042～0.750,平均0.250；期望杂合度(He)范围是0.232～0.823,平均0.522.
대31308조래자NCBI적파초속(Musa)EST서렬진행병접득도전장위13.51 Mb적21 129조무용여EST서렬(함3 818조contigs급17 311조singletons),기중,4 944조(23.40％)EST서렬함유5 416조SSRs,SSR적출현빈솔위25.63％,평균분포거리2.49 Kb,유234조(1.11％)함유1개이상적SSR.재소검측적SSR중,이、삼、사핵감산중복시주도중복류형,분별점EST-SSR총수적21.80％(1 181조)、52.55％ (2 846조)화14.55％(788조).AG/CT、AAG/CTT여AGG/CCT화AAAG/CTTT여AAAT/ATTT분별시이、삼、사핵감산적우세중복기원.수궤설계료238대EST-SSR인물재24개지용금련개체중진행사선,116대유확증산물,기중,78대EST-SSR궁물확증출청석은정적목적편단,49대인물표현출다태성.본연구검측적15대인물확증등위기인수범위시2～7개,평균3.067개；표관잡합도(Ho)범위시0.042～0.750,평균0.250；기망잡합도(He)범위시0.232～0.823,평균0.522.