生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2009年
1期
44-46,51
,共4页
马雅楠%孙平平%魏雅卓%陆林英%崔颖%马志强
馬雅楠%孫平平%魏雅卓%陸林英%崔穎%馬誌彊
마아남%손평평%위아탁%륙림영%최영%마지강
系统发育谱%参照基因组%权值%聚类
繫統髮育譜%參照基因組%權值%聚類
계통발육보%삼조기인조%권치%취류
系统发育谱方法是目前研究较多的一种基于非同源性的生物大分子功能注释方法.针对现有算法存在的一些缺陷,从两个方面对该方法做了改进:一是构造基于权重的系统发育谱;二是采用改进的聚类算法对发育谱的相似性进行分析.从NCBI上下载100条Escherichia coli K12蛋白质作为实验数据,分别使用改进的算法和经典的层次聚类算法、K均值聚类算法对相似谱进行分析.结果显示,提出的改进算法在对相似谱聚类的精确度上明显优于后两种聚类算法.
繫統髮育譜方法是目前研究較多的一種基于非同源性的生物大分子功能註釋方法.針對現有算法存在的一些缺陷,從兩箇方麵對該方法做瞭改進:一是構造基于權重的繫統髮育譜;二是採用改進的聚類算法對髮育譜的相似性進行分析.從NCBI上下載100條Escherichia coli K12蛋白質作為實驗數據,分彆使用改進的算法和經典的層次聚類算法、K均值聚類算法對相似譜進行分析.結果顯示,提齣的改進算法在對相似譜聚類的精確度上明顯優于後兩種聚類算法.
계통발육보방법시목전연구교다적일충기우비동원성적생물대분자공능주석방법.침대현유산법존재적일사결함,종량개방면대해방법주료개진:일시구조기우권중적계통발육보;이시채용개진적취류산법대발육보적상사성진행분석.종NCBI상하재100조Escherichia coli K12단백질작위실험수거,분별사용개진적산법화경전적층차취류산법、K균치취류산법대상사보진행분석.결과현시,제출적개진산법재대상사보취류적정학도상명현우우후량충취류산법.
