浙江大学学报(农业与生命科学版)
浙江大學學報(農業與生命科學版)
절강대학학보(농업여생명과학판)
2011年
4期
371-379
,共9页
马云%王云云%张晓婷%李芬%王启钊%王新庄
馬雲%王雲雲%張曉婷%李芬%王啟釗%王新莊
마운%왕운운%장효정%리분%왕계쇠%왕신장
鸭%过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因%生物信息学分析
鴨%過氧化物酶體增殖物激活受體α(PPARα)基因%生物信息學分析
압%과양화물매체증식물격활수체α(PPARα)기인%생물신식학분석
以鸭的过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因为研究对象,运用生物信息学方法对其编码的蛋白质结构、理化性质及功能结构域进行分析.结果表明:鸭的PPARα基因cDNA全长1 430 bp,最长开放阅读框为1 407 bp,编码468个氨基酸；序列比对结果显示鸭的PPARα基因与鸡、胸草雀、人、牛、家马等该基因的核苷酸序列同源性分别为96%、92%、79%、77%和78%,鸭PPARα基因编码的氨基酸序列与上述其他动物的同源性高达98%、97%、89%、89%和88%；系统进化分析结果显示,在鸡、胸草雀、人、牛、马等动物中,鸭的PPARα基因与鸡的进化关系最为密切,亲缘关系最近；鸭的PPARα蛋白中α螺旋较多,该蛋白质含有1段短的核定位信号序列KKNRNKC,在引导该蛋白质进入细胞核的过程中发挥作用,同时还有由2个锌指结构组成的DNA结合域及1段配体结合域.
以鴨的過氧化物酶體增殖物激活受體α(PPARα)基因為研究對象,運用生物信息學方法對其編碼的蛋白質結構、理化性質及功能結構域進行分析.結果錶明:鴨的PPARα基因cDNA全長1 430 bp,最長開放閱讀框為1 407 bp,編碼468箇氨基痠；序列比對結果顯示鴨的PPARα基因與鷄、胸草雀、人、牛、傢馬等該基因的覈苷痠序列同源性分彆為96%、92%、79%、77%和78%,鴨PPARα基因編碼的氨基痠序列與上述其他動物的同源性高達98%、97%、89%、89%和88%；繫統進化分析結果顯示,在鷄、胸草雀、人、牛、馬等動物中,鴨的PPARα基因與鷄的進化關繫最為密切,親緣關繫最近；鴨的PPARα蛋白中α螺鏇較多,該蛋白質含有1段短的覈定位信號序列KKNRNKC,在引導該蛋白質進入細胞覈的過程中髮揮作用,同時還有由2箇鋅指結構組成的DNA結閤域及1段配體結閤域.
이압적과양화물매체증식물격활수체α(PPARα)기인위연구대상,운용생물신식학방법대기편마적단백질결구、이화성질급공능결구역진행분석.결과표명:압적PPARα기인cDNA전장1 430 bp,최장개방열독광위1 407 bp,편마468개안기산；서렬비대결과현시압적PPARα기인여계、흉초작、인、우、가마등해기인적핵감산서렬동원성분별위96%、92%、79%、77%화78%,압PPARα기인편마적안기산서렬여상술기타동물적동원성고체98%、97%、89%、89%화88%；계통진화분석결과현시,재계、흉초작、인、우、마등동물중,압적PPARα기인여계적진화관계최위밀절,친연관계최근；압적PPARα단백중α라선교다,해단백질함유1단단적핵정위신호서렬KKNRNKC,재인도해단백질진입세포핵적과정중발휘작용,동시환유유2개자지결구조성적DNA결합역급1단배체결합역.
