中南林业科技大学学报
中南林業科技大學學報
중남임업과기대학학보
JOURNAL OF CENTRAL SOUTH UNIVERSITY OF FORESTRY & TECHNOLOGY
2011年
12期
111-117
,共7页
龙洪旭%谭晓风%张琳%谢禄山%陈洪
龍洪旭%譚曉風%張琳%謝祿山%陳洪
룡홍욱%담효풍%장림%사록산%진홍
油桐%亲环素%RACE%全长cDNA%序列分析
油桐%親環素%RACE%全長cDNA%序列分析
유동%친배소%RACE%전장cDNA%서렬분석
亲环素基因广泛分布于各种生命体中,植物亲环素在植物生物学、胁迫应答、抗病原体免疫等方面起重要作用.根据油桐EST文库中的已知部分亲环素基因序列,通过5'RACE和RT-PCR,得到一个油桐亲环素全长cDNA序列.此基因全长为681 bp,包含一个长为519bp的完整CDS,编码172个氨基酸,将该基因命名为vf_cyp.生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质相对分子量18 038.5 Da,理论等电点8.68.通过预测分析表明该蛋白无跨膜结构,不存在信号肽切割位点,二级结构以β折叠和无规卷曲为主,分别占36.05％和52.91％,具有典型的肽脯氨酰顺反异构酶活性区及植物亲环素基因特有的7个氨基酸插入序列KS/MGKPLH,通过亲缘进化分析表明油桐亲环素氨基酸序列与橙、杂柑、毛果杨亲环素基因的氨基酸序列相似性分别达到94％、94％、93％.
親環素基因廣汎分佈于各種生命體中,植物親環素在植物生物學、脅迫應答、抗病原體免疫等方麵起重要作用.根據油桐EST文庫中的已知部分親環素基因序列,通過5'RACE和RT-PCR,得到一箇油桐親環素全長cDNA序列.此基因全長為681 bp,包含一箇長為519bp的完整CDS,編碼172箇氨基痠,將該基因命名為vf_cyp.生物信息學分析錶明,該基因編碼的蛋白質相對分子量18 038.5 Da,理論等電點8.68.通過預測分析錶明該蛋白無跨膜結構,不存在信號肽切割位點,二級結構以β摺疊和無規捲麯為主,分彆佔36.05％和52.91％,具有典型的肽脯氨酰順反異構酶活性區及植物親環素基因特有的7箇氨基痠插入序列KS/MGKPLH,通過親緣進化分析錶明油桐親環素氨基痠序列與橙、雜柑、毛果楊親環素基因的氨基痠序列相似性分彆達到94％、94％、93％.
친배소기인엄범분포우각충생명체중,식물친배소재식물생물학、협박응답、항병원체면역등방면기중요작용.근거유동EST문고중적이지부분친배소기인서렬,통과5'RACE화RT-PCR,득도일개유동친배소전장cDNA서렬.차기인전장위681 bp,포함일개장위519bp적완정CDS,편마172개안기산,장해기인명명위vf_cyp.생물신식학분석표명,해기인편마적단백질상대분자량18 038.5 Da,이론등전점8.68.통과예측분석표명해단백무과막결구,불존재신호태절할위점,이급결구이β절첩화무규권곡위주,분별점36.05％화52.91％,구유전형적태포안선순반이구매활성구급식물친배소기인특유적7개안기산삽입서렬KS/MGKPLH,통과친연진화분석표명유동친배소안기산서렬여등、잡감、모과양친배소기인적안기산서렬상사성분별체도94％、94％、93％.
