台湾海峡
檯灣海峽
태만해협
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY IN TAIWAN STRAIT
2009年
2期
217-222
,共6页
刘兵%李太武%苏秀榕%史西志%李登峰%杜莉利
劉兵%李太武%囌秀榕%史西誌%李登峰%杜莉利
류병%리태무%소수용%사서지%리등봉%두리리
北仑港%宁波%细菌多样性%16SrDNA
北崙港%寧波%細菌多樣性%16SrDNA
북륜항%저파%세균다양성%16SrDNA
采用分子生物学方法对宁波北仑港冬季水体中的浮游细菌多样性进行了研究.提取水样中细菌基因组总DNA,以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,扩增产物经分子克隆、测序与序列分析,对水样中的细菌建立了16S rDNA克隆文库和系统发生树.结果表明,浮游细菌群落具有较高的多样性,34个克隆子分属2个不同的细菌类群,6个克隆子属于未知类群,优势细菌类群为Proteobacteria类群(变形菌类群),占80%;细菌优势类群顺序为β-Proteobacteria类群(32.5%)、γ-Proteobacteria类群(25%)、α-Proteobacteria类群(15%)、ε-proteobacteria类群(7.5%)、Firmicutes类群(厚壁菌类群)(5%).这一结果与近年来国内外有关港口微生物多样性的报道较为一致.用DNAStar中Clustalw程序从测序的40个克隆子中选出17个OTU进行系统发育分析,同样表明浮游细菌多样性较强.
採用分子生物學方法對寧波北崙港鼕季水體中的浮遊細菌多樣性進行瞭研究.提取水樣中細菌基因組總DNA,以細菌16S rDNA通用引物進行PCR擴增,擴增產物經分子剋隆、測序與序列分析,對水樣中的細菌建立瞭16S rDNA剋隆文庫和繫統髮生樹.結果錶明,浮遊細菌群落具有較高的多樣性,34箇剋隆子分屬2箇不同的細菌類群,6箇剋隆子屬于未知類群,優勢細菌類群為Proteobacteria類群(變形菌類群),佔80%;細菌優勢類群順序為β-Proteobacteria類群(32.5%)、γ-Proteobacteria類群(25%)、α-Proteobacteria類群(15%)、ε-proteobacteria類群(7.5%)、Firmicutes類群(厚壁菌類群)(5%).這一結果與近年來國內外有關港口微生物多樣性的報道較為一緻.用DNAStar中Clustalw程序從測序的40箇剋隆子中選齣17箇OTU進行繫統髮育分析,同樣錶明浮遊細菌多樣性較彊.
채용분자생물학방법대저파북륜항동계수체중적부유세균다양성진행료연구.제취수양중세균기인조총DNA,이세균16S rDNA통용인물진행PCR확증,확증산물경분자극륭、측서여서렬분석,대수양중적세균건립료16S rDNA극륭문고화계통발생수.결과표명,부유세균군락구유교고적다양성,34개극륭자분속2개불동적세균류군,6개극륭자속우미지류군,우세세균류군위Proteobacteria류군(변형균류군),점80%;세균우세류군순서위β-Proteobacteria류군(32.5%)、γ-Proteobacteria류군(25%)、α-Proteobacteria류군(15%)、ε-proteobacteria류군(7.5%)、Firmicutes류군(후벽균류군)(5%).저일결과여근년래국내외유관항구미생물다양성적보도교위일치.용DNAStar중Clustalw정서종측서적40개극륭자중선출17개OTU진행계통발육분석,동양표명부유세균다양성교강.
