作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2010年
7期
1067-1074
,共8页
吴韦铷%朱利泉%李成琼%杨昆%唐章林%任雪松%王小佳
吳韋銣%硃利泉%李成瓊%楊昆%唐章林%任雪鬆%王小佳
오위여%주리천%리성경%양곤%당장림%임설송%왕소가
自交不亲和性%信号转导%KAPP基因%甘蓝
自交不親和性%信號轉導%KAPP基因%甘藍
자교불친화성%신호전도%KAPP기인%감람
采用PCR、RT-PCR及其他分子生物学方法,以甘蓝基因组DNA、花蕾RNA和叶片RNA为模板,分别对甘蓝KAPP gDNA和KAPP cDNA进行扩增,分别获得3 247 bp的KAPP gDNA片段、1 699 bp的KAPP cDNA片段、1 578 bp的花蕾KAPP2 cDNA片段和1 581 bp的叶片KAPP2 cDNA片段.对克隆的甘蓝KAPP gDNA和cDNA(结合报道的KAPP cDNA)进行比对表明,甘蓝KAPP基因包含11个内含子,均符合"GU-AG"剪接规则,并且克隆得到的KAPP cDNA序列与报道的KAPP cDNA序列有6处单个碱基的差异,但两者的氨基酸序列完全一致.然而花蕾KAPP2 cDNA、叶片KAPP2 cDNA片段与报道的KAPP cDNA序列相似性分别为85.2%和85.0%.这两个序列分别在590 bp和593 bp处较早出现一个无义突变引起的终止密码子.Blast分析表明,两基因编码的氨基酸序列与拟南芥KAPP氨基酸序列相似性最高,其次为甘蓝KAPP氨基酸序列.以已报道的8种植物KAPP的CDS及本实验所克隆的两个KAPP2序列构建分子进化树,获得序列与甘蓝KAPP序列聚为一支.结合比较作图及分子进化树,推测KdPP基因在甘蓝基因组上有两个拷贝,而笔者克隆到的KAPP2 cDNA序列是其中一个拷贝,是KAPP进化过程中突变失活的拟基因.
採用PCR、RT-PCR及其他分子生物學方法,以甘藍基因組DNA、花蕾RNA和葉片RNA為模闆,分彆對甘藍KAPP gDNA和KAPP cDNA進行擴增,分彆穫得3 247 bp的KAPP gDNA片段、1 699 bp的KAPP cDNA片段、1 578 bp的花蕾KAPP2 cDNA片段和1 581 bp的葉片KAPP2 cDNA片段.對剋隆的甘藍KAPP gDNA和cDNA(結閤報道的KAPP cDNA)進行比對錶明,甘藍KAPP基因包含11箇內含子,均符閤"GU-AG"剪接規則,併且剋隆得到的KAPP cDNA序列與報道的KAPP cDNA序列有6處單箇堿基的差異,但兩者的氨基痠序列完全一緻.然而花蕾KAPP2 cDNA、葉片KAPP2 cDNA片段與報道的KAPP cDNA序列相似性分彆為85.2%和85.0%.這兩箇序列分彆在590 bp和593 bp處較早齣現一箇無義突變引起的終止密碼子.Blast分析錶明,兩基因編碼的氨基痠序列與擬南芥KAPP氨基痠序列相似性最高,其次為甘藍KAPP氨基痠序列.以已報道的8種植物KAPP的CDS及本實驗所剋隆的兩箇KAPP2序列構建分子進化樹,穫得序列與甘藍KAPP序列聚為一支.結閤比較作圖及分子進化樹,推測KdPP基因在甘藍基因組上有兩箇拷貝,而筆者剋隆到的KAPP2 cDNA序列是其中一箇拷貝,是KAPP進化過程中突變失活的擬基因.
채용PCR、RT-PCR급기타분자생물학방법,이감람기인조DNA、화뢰RNA화협편RNA위모판,분별대감람KAPP gDNA화KAPP cDNA진행확증,분별획득3 247 bp적KAPP gDNA편단、1 699 bp적KAPP cDNA편단、1 578 bp적화뢰KAPP2 cDNA편단화1 581 bp적협편KAPP2 cDNA편단.대극륭적감람KAPP gDNA화cDNA(결합보도적KAPP cDNA)진행비대표명,감람KAPP기인포함11개내함자,균부합"GU-AG"전접규칙,병차극륭득도적KAPP cDNA서렬여보도적KAPP cDNA서렬유6처단개감기적차이,단량자적안기산서렬완전일치.연이화뢰KAPP2 cDNA、협편KAPP2 cDNA편단여보도적KAPP cDNA서렬상사성분별위85.2%화85.0%.저량개서렬분별재590 bp화593 bp처교조출현일개무의돌변인기적종지밀마자.Blast분석표명,량기인편마적안기산서렬여의남개KAPP안기산서렬상사성최고,기차위감람KAPP안기산서렬.이이보도적8충식물KAPP적CDS급본실험소극륭적량개KAPP2서렬구건분자진화수,획득서렬여감람KAPP서렬취위일지.결합비교작도급분자진화수,추측KdPP기인재감람기인조상유량개고패,이필자극륭도적KAPP2 cDNA서렬시기중일개고패,시KAPP진화과정중돌변실활적의기인.