浙江大学学报（农业与生命科学版）
浙江大學學報（農業與生命科學版）
절강대학학보（농업여생명과학판）
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(AGRICULTURE & LIFE SCIENCES)
2011年
5期
485-492
,共8页
贺道华%邢宏宜%赵俊兴%赵艳宁%齐程%王艳婷
賀道華%邢宏宜%趙俊興%趙豔寧%齊程%王豔婷
하도화%형굉의%조준흥%조염저%제정%왕염정
多倍体%单核苷酸多态性%标记开发%部分同源性
多倍體%單覈苷痠多態性%標記開髮%部分同源性
다배체%단핵감산다태성%표기개발%부분동원성
单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由单核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性.在人、拟南芥、水稻等二倍体生物中,已经开发出大量的SNP标记并被用于群体结构分析、关联作图等研究,而在棉花、油莱、小麦等多倍体植物中,SNP的开发与应用却进展迟缓.为促进多倍体植物中SNP的开发,本文对多倍体植物中SNP标记开发所遇到的难题进行了阐述,并对多倍体中SNP标记开发方法进行了梳理,包括位点特异性引物的PCR片段直接测序,利用多倍体的近缘二倍体区分SNPs和部分同源序列间的差异(homoeologous sequence variants,HSVs),利用2代测序技术大规模发掘SNPs,基于公共数据库的序列通过生物信息学分析获取候选SNPs,通过遗传(分离)模式的研究验证SNPs等.利用上述方法可实现多倍体植物中SNP标记的大规模开发.
單覈苷痠多態性(SNP)是指在基因組水平上由單覈苷痠的變異所引起的一種DNA序列多態性.在人、擬南芥、水稻等二倍體生物中,已經開髮齣大量的SNP標記併被用于群體結構分析、關聯作圖等研究,而在棉花、油萊、小麥等多倍體植物中,SNP的開髮與應用卻進展遲緩.為促進多倍體植物中SNP的開髮,本文對多倍體植物中SNP標記開髮所遇到的難題進行瞭闡述,併對多倍體中SNP標記開髮方法進行瞭梳理,包括位點特異性引物的PCR片段直接測序,利用多倍體的近緣二倍體區分SNPs和部分同源序列間的差異(homoeologous sequence variants,HSVs),利用2代測序技術大規模髮掘SNPs,基于公共數據庫的序列通過生物信息學分析穫取候選SNPs,通過遺傳(分離)模式的研究驗證SNPs等.利用上述方法可實現多倍體植物中SNP標記的大規模開髮.
단핵감산다태성(SNP)시지재기인조수평상유단핵감산적변이소인기적일충DNA서렬다태성.재인、의남개、수도등이배체생물중,이경개발출대량적SNP표기병피용우군체결구분석、관련작도등연구,이재면화、유래、소맥등다배체식물중,SNP적개발여응용각진전지완.위촉진다배체식물중SNP적개발,본문대다배체식물중SNP표기개발소우도적난제진행료천술,병대다배체중SNP표기개발방법진행료소리,포괄위점특이성인물적PCR편단직접측서,이용다배체적근연이배체구분SNPs화부분동원서렬간적차이(homoeologous sequence variants,HSVs),이용2대측서기술대규모발굴SNPs,기우공공수거고적서렬통과생물신식학분석획취후선SNPs,통과유전(분리)모식적연구험증SNPs등.이용상술방법가실현다배체식물중SNP표기적대규모개발.
