湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2012年
13期
2861-2863
,共3页
癌基因%碱基序列%相空间聚类%生物学功能%相空间关联
癌基因%堿基序列%相空間聚類%生物學功能%相空間關聯
암기인%감기서렬%상공간취류%생물학공능%상공간관련
提取6个癌基因(BAK1、ccnd1、A DA MTS1、ADAM17、A DA MTS8、A GER)的碱基序列,借助MATLAB软件编写程序代码,检索6个癌基因碱基序列的4种单一碱基(A、T、C、C)的概率和64种三碱基组(AAA、AAT、AAC、……、GGG)的概率;对6个癌基因碱基序列的各种分布进行相空间聚类.结果表明,所在染色体不同、所在细胞不同、序列长度不同的6个癌基因碱基序列的结构特点与其生物学功能之间存在着明确的相空间关联.对生物学功能未知的基因和生物学功能已知的基因进行碱基序列结构特点分析和相空间聚类,可以由聚类结果预测功能未知基因是否具有与功能已知基因相似的生物学功能,这为寻找具有某种生物学功能的基因和预测基因是否具有某种生物学功能提供了一个有效途径.
提取6箇癌基因(BAK1、ccnd1、A DA MTS1、ADAM17、A DA MTS8、A GER)的堿基序列,藉助MATLAB軟件編寫程序代碼,檢索6箇癌基因堿基序列的4種單一堿基(A、T、C、C)的概率和64種三堿基組(AAA、AAT、AAC、……、GGG)的概率;對6箇癌基因堿基序列的各種分佈進行相空間聚類.結果錶明,所在染色體不同、所在細胞不同、序列長度不同的6箇癌基因堿基序列的結構特點與其生物學功能之間存在著明確的相空間關聯.對生物學功能未知的基因和生物學功能已知的基因進行堿基序列結構特點分析和相空間聚類,可以由聚類結果預測功能未知基因是否具有與功能已知基因相似的生物學功能,這為尋找具有某種生物學功能的基因和預測基因是否具有某種生物學功能提供瞭一箇有效途徑.
제취6개암기인(BAK1、ccnd1、A DA MTS1、ADAM17、A DA MTS8、A GER)적감기서렬,차조MATLAB연건편사정서대마,검색6개암기인감기서렬적4충단일감기(A、T、C、C)적개솔화64충삼감기조(AAA、AAT、AAC、……、GGG)적개솔;대6개암기인감기서렬적각충분포진행상공간취류.결과표명,소재염색체불동、소재세포불동、서렬장도불동적6개암기인감기서렬적결구특점여기생물학공능지간존재착명학적상공간관련.대생물학공능미지적기인화생물학공능이지적기인진행감기서렬결구특점분석화상공간취류,가이유취류결과예측공능미지기인시부구유여공능이지기인상사적생물학공능,저위심조구유모충생물학공능적기인화예측기인시부구유모충생물학공능제공료일개유효도경.