生物技术进展
生物技術進展
생물기술진전
2012年
1期
52-56
,共5页
吴一雷%闫鹏程%刘充%陈禹保%赵文明
吳一雷%閆鵬程%劉充%陳禹保%趙文明
오일뢰%염붕정%류충%진우보%조문명
高通量测序%转录组分析%弹性云平台%基因组数据库%分布式系统
高通量測序%轉錄組分析%彈性雲平檯%基因組數據庫%分佈式繫統
고통량측서%전록조분석%탄성운평태%기인조수거고%분포식계통
高通量RNA测序(RNA-seq)技术为研究人员提供了海量数据,如何对这些数据进行快速有效的分析,并为后续转录组、基因表达等研究提供支持,是生物信息学领域的热点方向.本文讨论了当前RNA-seq数据分析的发展水平和常用软件、算法,并设计了一系列数据处理模块和分析流程.同时,为了给用户提供更好的使用环境,我们设计了基于弹性资源管理系统的生物云平台BioCloud.该平台集成了丰富的软件,采用高灵活度、高扩展性的体系架构,在给用户提供低成本、高性能计算服务的同时,还提供个性化的流程定制服务.
高通量RNA測序(RNA-seq)技術為研究人員提供瞭海量數據,如何對這些數據進行快速有效的分析,併為後續轉錄組、基因錶達等研究提供支持,是生物信息學領域的熱點方嚮.本文討論瞭噹前RNA-seq數據分析的髮展水平和常用軟件、算法,併設計瞭一繫列數據處理模塊和分析流程.同時,為瞭給用戶提供更好的使用環境,我們設計瞭基于彈性資源管理繫統的生物雲平檯BioCloud.該平檯集成瞭豐富的軟件,採用高靈活度、高擴展性的體繫架構,在給用戶提供低成本、高性能計算服務的同時,還提供箇性化的流程定製服務.
고통량RNA측서(RNA-seq)기술위연구인원제공료해량수거,여하대저사수거진행쾌속유효적분석,병위후속전록조、기인표체등연구제공지지,시생물신식학영역적열점방향.본문토론료당전RNA-seq수거분석적발전수평화상용연건、산법,병설계료일계렬수거처리모괴화분석류정.동시,위료급용호제공경호적사용배경,아문설계료기우탄성자원관리계통적생물운평태BioCloud.해평태집성료봉부적연건,채용고령활도、고확전성적체계가구,재급용호제공저성본、고성능계산복무적동시,환제공개성화적류정정제복무.
