CAJ | 학술논문

采用二维HP模型用精确计数法和Monte Carlo方法研究了链长为N(≤22)的紧密高分子链的构象和热力学性质.发现不同HP序列的紧密高分子链的平均自由能和平均配分函数与链长N存在关系:〈F〉＝aN+b, ln〈Z〉＝a′N+b′.同时发现对于可折叠成基态且简并度为1的紧密高分子链,其平均自由能和平均配分函数与链长N也存在相似的关系.在HP模型中对于链长为N的紧密高分子链,存在着2N+1个不同的HP序列.我们发现可以折叠成基态且简并度为1的蛋白质分子的HP序列数目NS为NS＝a×2N+1 (a=0.025),对应的HP序列中,疏水基团(H)数目的含量为40%～60%的序列出现的几率最大.同时在这些紧密高分子链中有些具有相同的结构,发现结构的‘简并度'为3.3～4.0(10≤N≤16).在紧密高分子链折叠过程中,折叠的初期能量下降比较快,折叠的中期能量下降比较缓慢,折叠的后期能量下降也是比较快.
채용이유HP모형용정학계수법화Monte Carlo방법연구료련장위N(≤22)적긴밀고분자련적구상화열역학성질.발현불동HP서렬적긴밀고분자련적평균자유능화평균배분함수여련장N존재관계:〈F〉＝aN+b, ln〈Z〉＝a′N+b′.동시발현대우가절첩성기태차간병도위1적긴밀고분자련,기평균자유능화평균배분함수여련장N야존재상사적관계.재HP모형중대우련장위N적긴밀고분자련,존재착2N+1개불동적HP서렬.아문발현가이절첩성기태차간병도위1적단백질분자적HP서렬수목NS위NS＝a×2N+1 (a=0.025),대응적HP서렬중,소수기단(H)수목적함량위40%～60%적서렬출현적궤솔최대.동시재저사긴밀고분자련중유사구유상동적결구,발현결구적‘간병도'위3.3～4.0(10≤N≤16).재긴밀고분자련절첩과정중,절첩적초기능량하강비교쾌,절첩적중기능량하강비교완만,절첩적후기능량하강야시비교쾌.