遗传学报
遺傳學報
유전학보
ACTA GENETICA SINICA
2004年
6期
582-590
,共9页
莫赛军%宋平%罗大极%彭茂宇%张亮%姚海兰%周伟%张竟男%潘云峰%郑曙明
莫賽軍%宋平%囉大極%彭茂宇%張亮%姚海蘭%週偉%張竟男%潘雲峰%鄭曙明
막새군%송평%라대겁%팽무우%장량%요해란%주위%장경남%반운봉%정서명
鲫鱼%GH Ⅰ基因%内含子%多态性
鯽魚%GH Ⅰ基因%內含子%多態性
즉어%GH Ⅰ기인%내함자%다태성
利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Denaturing-Polyacrylamid Gel Electrophoresis,DPAGE)和单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析技术,在普通鲫鱼种群(7个野生鲫鱼群体和2个金鱼群体)和银鲫种群(1个方正银鲫群体)共162个个体生长激素I(Growth Hormone I,GH Ⅰ)基因的内含子2中检测到丰富的长度和序列多态性.在所有群体中,GH J基因内含子2的长度存在7种类型,分别为A、B、C、D、E、F和G型,变异频率为4.32%;其序列存在15种单倍型,分别为A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、D5、E1、E2、F和G型,变异频率为9.26%.对这15种单倍型的DNA序列进行分析,结果表明:1)鲫鱼GH I基因内含子2的扩增DNA片段长为243～263 bp,其中包括部分外显子2(3'端,33 bp)、内含子2和部分外显子3(5'端,21 bp).15种单倍型A、T、G、C碱基平均百分比组成分别为34.13%、37.36%、15.13%、13.38%,其中G+C(28.51%)含量明显小于A+T(71.49%)含量.内含子2与外显子2、3的接头区存在GT-AG保守序列,此为真核基因中mRNA剪接的识别信号.内含子2的5'端存在有一序列为GTAAGAT的保守区域,在其近3'端分布有一高丰度嘧啶区;2)内含子2的7种长度类型A、B、C、D、E、F和G型分别为189、196、204、205、206、207和209 bp,其差异主要由单碱基T重复次数N不同(N=0、8、9、10、11和13)和3种序列(TGAAAAC、TT和GAGTG)中1种或2种序列的缺失所引起;3)内含子2的15种单倍型的核苷酸序列中共有17个突变位点,包括2个碱基颠换突变位点和15个碱基转换突变位点,碱基转换突变频率为88.24%,明显高于颠换突变频率(11.76%).普通鲫鱼种群中金鱼群体Dhb、Dhr的GH Ⅰ基因内含子2均为长度类型A,含有两种序列单倍型(以下简称单倍型)即A1和A2;野生鲫鱼群体的内含子长度和序列变异较大,检测到A、B、C、D、E、F、G 7种长度类型和14种单倍型(A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、E1、E2、F和G型).在银鲫种群CaG中检测到C和D两种长度类型和4种序列单倍型(C1、C2、D2和D5),其中D5仅在此种群中检测到.
利用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(Denaturing-Polyacrylamid Gel Electrophoresis,DPAGE)和單鏈構象多態性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析技術,在普通鯽魚種群(7箇野生鯽魚群體和2箇金魚群體)和銀鯽種群(1箇方正銀鯽群體)共162箇箇體生長激素I(Growth Hormone I,GH Ⅰ)基因的內含子2中檢測到豐富的長度和序列多態性.在所有群體中,GH J基因內含子2的長度存在7種類型,分彆為A、B、C、D、E、F和G型,變異頻率為4.32%;其序列存在15種單倍型,分彆為A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、D5、E1、E2、F和G型,變異頻率為9.26%.對這15種單倍型的DNA序列進行分析,結果錶明:1)鯽魚GH I基因內含子2的擴增DNA片段長為243～263 bp,其中包括部分外顯子2(3'耑,33 bp)、內含子2和部分外顯子3(5'耑,21 bp).15種單倍型A、T、G、C堿基平均百分比組成分彆為34.13%、37.36%、15.13%、13.38%,其中G+C(28.51%)含量明顯小于A+T(71.49%)含量.內含子2與外顯子2、3的接頭區存在GT-AG保守序列,此為真覈基因中mRNA剪接的識彆信號.內含子2的5'耑存在有一序列為GTAAGAT的保守區域,在其近3'耑分佈有一高豐度嘧啶區;2)內含子2的7種長度類型A、B、C、D、E、F和G型分彆為189、196、204、205、206、207和209 bp,其差異主要由單堿基T重複次數N不同(N=0、8、9、10、11和13)和3種序列(TGAAAAC、TT和GAGTG)中1種或2種序列的缺失所引起;3)內含子2的15種單倍型的覈苷痠序列中共有17箇突變位點,包括2箇堿基顛換突變位點和15箇堿基轉換突變位點,堿基轉換突變頻率為88.24%,明顯高于顛換突變頻率(11.76%).普通鯽魚種群中金魚群體Dhb、Dhr的GH Ⅰ基因內含子2均為長度類型A,含有兩種序列單倍型(以下簡稱單倍型)即A1和A2;野生鯽魚群體的內含子長度和序列變異較大,檢測到A、B、C、D、E、F、G 7種長度類型和14種單倍型(A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、E1、E2、F和G型).在銀鯽種群CaG中檢測到C和D兩種長度類型和4種序列單倍型(C1、C2、D2和D5),其中D5僅在此種群中檢測到.
이용변성취병희선알응효전영(Denaturing-Polyacrylamid Gel Electrophoresis,DPAGE)화단련구상다태성(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)분석기술,재보통즉어충군(7개야생즉어군체화2개금어군체)화은즉충군(1개방정은즉군체)공162개개체생장격소I(Growth Hormone I,GH Ⅰ)기인적내함자2중검측도봉부적장도화서렬다태성.재소유군체중,GH J기인내함자2적장도존재7충류형,분별위A、B、C、D、E、F화G형,변이빈솔위4.32%;기서렬존재15충단배형,분별위A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、D5、E1、E2、F화G형,변이빈솔위9.26%.대저15충단배형적DNA서렬진행분석,결과표명:1)즉어GH I기인내함자2적확증DNA편단장위243～263 bp,기중포괄부분외현자2(3'단,33 bp)、내함자2화부분외현자3(5'단,21 bp).15충단배형A、T、G、C감기평균백분비조성분별위34.13%、37.36%、15.13%、13.38%,기중G+C(28.51%)함량명현소우A+T(71.49%)함량.내함자2여외현자2、3적접두구존재GT-AG보수서렬,차위진핵기인중mRNA전접적식별신호.내함자2적5'단존재유일서렬위GTAAGAT적보수구역,재기근3'단분포유일고봉도밀정구;2)내함자2적7충장도류형A、B、C、D、E、F화G형분별위189、196、204、205、206、207화209 bp,기차이주요유단감기T중복차수N불동(N=0、8、9、10、11화13)화3충서렬(TGAAAAC、TT화GAGTG)중1충혹2충서렬적결실소인기;3)내함자2적15충단배형적핵감산서렬중공유17개돌변위점,포괄2개감기전환돌변위점화15개감기전환돌변위점,감기전환돌변빈솔위88.24%,명현고우전환돌변빈솔(11.76%).보통즉어충군중금어군체Dhb、Dhr적GH Ⅰ기인내함자2균위장도류형A,함유량충서렬단배형(이하간칭단배형)즉A1화A2;야생즉어군체적내함자장도화서렬변이교대,검측도A、B、C、D、E、F、G 7충장도류형화14충단배형(A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、E1、E2、F화G형).재은즉충군CaG중검측도C화D량충장도류형화4충서렬단배형(C1、C2、D2화D5),기중D5부재차충군중검측도.
