西北农业学报
西北農業學報
서북농업학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-OCCIDENTALIS SINICA
2008年
3期
7-11
,共5页
魏秀丽%孙亚妮%姜世金%孔义波%张兴晓
魏秀麗%孫亞妮%薑世金%孔義波%張興曉
위수려%손아니%강세금%공의파%장흥효
鸭疫里默氏杆菌%外膜蛋白A%序列分析
鴨疫裏默氏桿菌%外膜蛋白A%序列分析
압역리묵씨간균%외막단백A%서렬분석
为了对鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer, RA)中国分离株的外膜蛋白A (OmpA)基因的序列进行分析,根据GenBank中已发表的鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer, RA)的外膜蛋白A (OmpA)基因序列,在其高度保守区设计一对特异性引物,应用PCR技术,分别扩增从中国广东、福建和山东等地分离的8株鸭疫里默氏杆菌中国分离株的OmpA基因,克隆测序后与GenBank中已发表的26株鸭疫里默氏杆菌进行序列比较,结果表明:所有菌株的OmpA基因均为由1164个碱基组成的ORF,编码387个氨基酸组成的蛋白质,起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA,其核苷酸序列非常保守,同源性高达88.2%~100%,氨基酸同源性达到88.9%~100%.试验表明,OmpA基因具有种内相对保守性,其核苷酸与氨基酸同源性与鸭疫里默氏杆菌的血清型、分离时间和地点之间无必然联系.
為瞭對鴨疫裏默氏桿菌(Riemerella anatipestifer, RA)中國分離株的外膜蛋白A (OmpA)基因的序列進行分析,根據GenBank中已髮錶的鴨疫裏默氏桿菌(Riemerella anatipestifer, RA)的外膜蛋白A (OmpA)基因序列,在其高度保守區設計一對特異性引物,應用PCR技術,分彆擴增從中國廣東、福建和山東等地分離的8株鴨疫裏默氏桿菌中國分離株的OmpA基因,剋隆測序後與GenBank中已髮錶的26株鴨疫裏默氏桿菌進行序列比較,結果錶明:所有菌株的OmpA基因均為由1164箇堿基組成的ORF,編碼387箇氨基痠組成的蛋白質,起始密碼子均為ATG,終止密碼子均為TAA,其覈苷痠序列非常保守,同源性高達88.2%~100%,氨基痠同源性達到88.9%~100%.試驗錶明,OmpA基因具有種內相對保守性,其覈苷痠與氨基痠同源性與鴨疫裏默氏桿菌的血清型、分離時間和地點之間無必然聯繫.
위료대압역리묵씨간균(Riemerella anatipestifer, RA)중국분리주적외막단백A (OmpA)기인적서렬진행분석,근거GenBank중이발표적압역리묵씨간균(Riemerella anatipestifer, RA)적외막단백A (OmpA)기인서렬,재기고도보수구설계일대특이성인물,응용PCR기술,분별확증종중국엄동、복건화산동등지분리적8주압역리묵씨간균중국분리주적OmpA기인,극륭측서후여GenBank중이발표적26주압역리묵씨간균진행서렬비교,결과표명:소유균주적OmpA기인균위유1164개감기조성적ORF,편마387개안기산조성적단백질,기시밀마자균위ATG,종지밀마자균위TAA,기핵감산서렬비상보수,동원성고체88.2%~100%,안기산동원성체도88.9%~100%.시험표명,OmpA기인구유충내상대보수성,기핵감산여안기산동원성여압역리묵씨간균적혈청형、분리시간화지점지간무필연련계.