病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2004年
1期
62-66
,共5页
石正丽%解云礼%汤显春%Sri Widada Joannes%Bonami Jean-Robert
石正麗%解雲禮%湯顯春%Sri Widada Joannes%Bonami Jean-Robert
석정려%해운례%탕현춘%Sri Widada Joannes%Bonami Jean-Robert
罗氏沼虾%诺达病毒%点杂交%RT-PCR%序列分析
囉氏沼蝦%諾達病毒%點雜交%RT-PCR%序列分析
라씨소하%낙체병독%점잡교%RT-PCR%서렬분석
根据安替列群岛分离的罗氏沼虾诺达病毒株基因组序列(MrNV-ant),制备特异性核酸探针,设计特异性引物,用点杂交和RT-PCR的方法检测在中国境内分离的罗氏沼虾诺达病毒(MrNV-chin).点杂交的方法可以检测出少于26ng的患肌肉白浊症的组织样品中的病毒,或少于25ng的病毒RNA样品;RT-PCR可以检测出少于25pg的RNA样品.扩增的MrNV-chin RNA1序列长858个核苷酸,与MrNV-ant的核苷酸一致率为957%,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为99.7%.扩增的MrNV-chin RNA 2序列长1121个核苷酸,与MrNV-ant的核苷酸一致率为92%,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为93.2%.因此,MrNV-ant和MrNV-chin应属于同一种病毒的不同分离株.用两株罗氏沼虾诺达病毒的RNA聚合酶序列与其它6株诺达病毒RNA聚合酶序列比较后构建的进化树中,罗氏沼虾诺达病毒与Alphanodavirus的亲缘关系近于与Betanodavirus的亲缘,组成了一个新的分支.
根據安替列群島分離的囉氏沼蝦諾達病毒株基因組序列(MrNV-ant),製備特異性覈痠探針,設計特異性引物,用點雜交和RT-PCR的方法檢測在中國境內分離的囉氏沼蝦諾達病毒(MrNV-chin).點雜交的方法可以檢測齣少于26ng的患肌肉白濁癥的組織樣品中的病毒,或少于25ng的病毒RNA樣品;RT-PCR可以檢測齣少于25pg的RNA樣品.擴增的MrNV-chin RNA1序列長858箇覈苷痠,與MrNV-ant的覈苷痠一緻率為957%,兩者翻譯後的氨基痠序列的一緻率為99.7%.擴增的MrNV-chin RNA 2序列長1121箇覈苷痠,與MrNV-ant的覈苷痠一緻率為92%,兩者翻譯後的氨基痠序列的一緻率為93.2%.因此,MrNV-ant和MrNV-chin應屬于同一種病毒的不同分離株.用兩株囉氏沼蝦諾達病毒的RNA聚閤酶序列與其它6株諾達病毒RNA聚閤酶序列比較後構建的進化樹中,囉氏沼蝦諾達病毒與Alphanodavirus的親緣關繫近于與Betanodavirus的親緣,組成瞭一箇新的分支.
근거안체렬군도분리적라씨소하낙체병독주기인조서렬(MrNV-ant),제비특이성핵산탐침,설계특이성인물,용점잡교화RT-PCR적방법검측재중국경내분리적라씨소하낙체병독(MrNV-chin).점잡교적방법가이검측출소우26ng적환기육백탁증적조직양품중적병독,혹소우25ng적병독RNA양품;RT-PCR가이검측출소우25pg적RNA양품.확증적MrNV-chin RNA1서렬장858개핵감산,여MrNV-ant적핵감산일치솔위957%,량자번역후적안기산서렬적일치솔위99.7%.확증적MrNV-chin RNA 2서렬장1121개핵감산,여MrNV-ant적핵감산일치솔위92%,량자번역후적안기산서렬적일치솔위93.2%.인차,MrNV-ant화MrNV-chin응속우동일충병독적불동분리주.용량주라씨소하낙체병독적RNA취합매서렬여기타6주낙체병독RNA취합매서렬비교후구건적진화수중,라씨소하낙체병독여Alphanodavirus적친연관계근우여Betanodavirus적친연,조성료일개신적분지.