果树学报
果樹學報
과수학보
JOURNAL OF FRUIT SCIENCE
2008年
3期
338-342
,共5页
张树军%黄绍西%张绍铃%吴俊%衡伟%吴华清%宋宏峰
張樹軍%黃紹西%張紹鈴%吳俊%衡偉%吳華清%宋宏峰
장수군%황소서%장소령%오준%형위%오화청%송굉봉
李%自交不亲和性%S-Nase基因
李%自交不親和性%S-Nase基因
리%자교불친화성%S-Nase기인
利用李属S-RNase基因特异性引物,对15个供试李品种进行PCR扩增,共获得30个目的条带.对这些目的条带进行测序鉴定出15个李品种的S基因型.通过与NCBI中利用BLASTn与GenBank+EMBL+DDBJ+PDB等数据库中的序列比对,结果表明,其中9个为新S-RNases基因,对9个新S-RNases核苷酸序列进行分析发现,位于高变区内的内含子大小为141～1758bp,其同源性为33.9%(S-18～S-19)～81.6%(S-20～S-21),表现出丰富的长度和序列多态性;编码区的核苷酸序列比对结果,其同源性为73.3%(S-16～S-19)～91.7%(S-17～S-22);其推导氨基酸序列相似性为67.3%(S-16～S-19)～89.1%(S-17～S-22);包含李属S-RNase一级结构所共有的C2、C3保守区和高变区(RHV).系统进化分析表明,9个新S-RNases与李属其它树种S-RNases聚类在一起,归属为李亚科(Prunoideae).
利用李屬S-RNase基因特異性引物,對15箇供試李品種進行PCR擴增,共穫得30箇目的條帶.對這些目的條帶進行測序鑒定齣15箇李品種的S基因型.通過與NCBI中利用BLASTn與GenBank+EMBL+DDBJ+PDB等數據庫中的序列比對,結果錶明,其中9箇為新S-RNases基因,對9箇新S-RNases覈苷痠序列進行分析髮現,位于高變區內的內含子大小為141～1758bp,其同源性為33.9%(S-18～S-19)～81.6%(S-20～S-21),錶現齣豐富的長度和序列多態性;編碼區的覈苷痠序列比對結果,其同源性為73.3%(S-16～S-19)～91.7%(S-17～S-22);其推導氨基痠序列相似性為67.3%(S-16～S-19)～89.1%(S-17～S-22);包含李屬S-RNase一級結構所共有的C2、C3保守區和高變區(RHV).繫統進化分析錶明,9箇新S-RNases與李屬其它樹種S-RNases聚類在一起,歸屬為李亞科(Prunoideae).
이용리속S-RNase기인특이성인물,대15개공시리품충진행PCR확증,공획득30개목적조대.대저사목적조대진행측서감정출15개리품충적S기인형.통과여NCBI중이용BLASTn여GenBank+EMBL+DDBJ+PDB등수거고중적서렬비대,결과표명,기중9개위신S-RNases기인,대9개신S-RNases핵감산서렬진행분석발현,위우고변구내적내함자대소위141～1758bp,기동원성위33.9%(S-18～S-19)～81.6%(S-20～S-21),표현출봉부적장도화서렬다태성;편마구적핵감산서렬비대결과,기동원성위73.3%(S-16～S-19)～91.7%(S-17～S-22);기추도안기산서렬상사성위67.3%(S-16～S-19)～89.1%(S-17～S-22);포함리속S-RNase일급결구소공유적C2、C3보수구화고변구(RHV).계통진화분석표명,9개신S-RNases여리속기타수충S-RNases취류재일기,귀속위리아과(Prunoideae).
