西北农业学报
西北農業學報
서북농업학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-OCCIDENTALIS SINICA
2011年
3期
8-14
,共7页
王维%罗军%钟瑜%朱越%滕炎玲%林先滋%王桢
王維%囉軍%鐘瑜%硃越%滕炎玲%林先滋%王楨
왕유%라군%종유%주월%등염령%림선자%왕정
西农萨能奶山羊%LXRα%序列分析%组织表达
西農薩能奶山羊%LXRα%序列分析%組織錶達
서농살능내산양%LXRα%서렬분석%조직표체
采集西农萨能奶山羊乳腺组织,利用RT-PCR和RACE技术分离并克隆LXRα基因的cDNA序列.其全长1 654 bp(GenBank收录号为GU 332719),包括5'UTR 150 bp,CDS1 344 by和3'UTR 160 bp,该基因编码447个氨基酸.经氨基酸序列分析发现,山羊LXRα与GenBank中牛(Bos taurus)、小鼠(Mus muscuLus)、褐鼠(Rattus norvegicus)、猪(Sus scrofa)和人(Homo sa piens)的L XRα相似性较高,均在90%以上.蛋白质结构分析表明,其蛋白质分子量为50.35 ku,等电点为6.3.具有受体特征结构域:配体结合区域(Ligand-binding Domain,LBD),DNA结合区域(DNA-binding Domain,DBD)和锌指蛋白C4型区域(Zinc fingerC4 type,zf-C4),整个序列具有较强的亲水性且不含信号肽与跨膜结构,该基因定位于细胞核.此外,还通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术对LXRα基因进行组织表达分析.在所检测的西农萨能奶山羊11个组织中均有LXRα基因的mRNA存在,其中小肠组织中表达最丰富,乳腺、肝脏、脾脏、皮脂次之,心脏相对最低.
採集西農薩能奶山羊乳腺組織,利用RT-PCR和RACE技術分離併剋隆LXRα基因的cDNA序列.其全長1 654 bp(GenBank收錄號為GU 332719),包括5'UTR 150 bp,CDS1 344 by和3'UTR 160 bp,該基因編碼447箇氨基痠.經氨基痠序列分析髮現,山羊LXRα與GenBank中牛(Bos taurus)、小鼠(Mus muscuLus)、褐鼠(Rattus norvegicus)、豬(Sus scrofa)和人(Homo sa piens)的L XRα相似性較高,均在90%以上.蛋白質結構分析錶明,其蛋白質分子量為50.35 ku,等電點為6.3.具有受體特徵結構域:配體結閤區域(Ligand-binding Domain,LBD),DNA結閤區域(DNA-binding Domain,DBD)和鋅指蛋白C4型區域(Zinc fingerC4 type,zf-C4),整箇序列具有較彊的親水性且不含信號肽與跨膜結構,該基因定位于細胞覈.此外,還通過實時熒光定量PCR(RT-qPCR)技術對LXRα基因進行組織錶達分析.在所檢測的西農薩能奶山羊11箇組織中均有LXRα基因的mRNA存在,其中小腸組織中錶達最豐富,乳腺、肝髒、脾髒、皮脂次之,心髒相對最低.
채집서농살능내산양유선조직,이용RT-PCR화RACE기술분리병극륭LXRα기인적cDNA서렬.기전장1 654 bp(GenBank수록호위GU 332719),포괄5'UTR 150 bp,CDS1 344 by화3'UTR 160 bp,해기인편마447개안기산.경안기산서렬분석발현,산양LXRα여GenBank중우(Bos taurus)、소서(Mus muscuLus)、갈서(Rattus norvegicus)、저(Sus scrofa)화인(Homo sa piens)적L XRα상사성교고,균재90%이상.단백질결구분석표명,기단백질분자량위50.35 ku,등전점위6.3.구유수체특정결구역:배체결합구역(Ligand-binding Domain,LBD),DNA결합구역(DNA-binding Domain,DBD)화자지단백C4형구역(Zinc fingerC4 type,zf-C4),정개서렬구유교강적친수성차불함신호태여과막결구,해기인정위우세포핵.차외,환통과실시형광정량PCR(RT-qPCR)기술대LXRα기인진행조직표체분석.재소검측적서농살능내산양11개조직중균유LXRα기인적mRNA존재,기중소장조직중표체최봉부,유선、간장、비장、피지차지,심장상대최저.