四川大学学报(自然科学版)
四川大學學報(自然科學版)
사천대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF SICHUAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2011年
4期
935-942
,共8页
高继海%朱勋路%徐莺%陈放
高繼海%硃勛路%徐鶯%陳放
고계해%주훈로%서앵%진방
麻疯树%均一化全长cDNA文库%表达序列标签%库容
痳瘋樹%均一化全長cDNA文庫%錶達序列標籤%庫容
마풍수%균일화전장cDNA문고%표체서렬표첨%고용
以麻疯树根、茎、叶、花和果实为材料,使用DSN (duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanism at 5' end of RNA transcript)建库技术相结合,构建了麻疯树全植株均一化全长cDNA文库.经检测库容为1.4×106个克隆,插入片段平均长度大于1 kb.随机挑取200个克隆,利用PCR方法测得文库重组率达95%,48.95%的EST(Expressed Sequence Tag)没有同源性,显示了这些ESTs中能够发现新功能基因的可能性.与GeneBank Nr数据库中已知功能基因有较高同源性的有97条ESTs,相关同源性的已知基因分别参与基础代谢与运输、细胞构成、能量转换、辅酶代谢与运输、信号传导、翻译机翻译后的修饰折叠等过程.这是第一次以麻疯树全植株为材料构建全长均一化cDNA文库.
以痳瘋樹根、莖、葉、花和果實為材料,使用DSN (duplex-specific nuclease)均一化技術與SMART(switching mechanism at 5' end of RNA transcript)建庫技術相結閤,構建瞭痳瘋樹全植株均一化全長cDNA文庫.經檢測庫容為1.4×106箇剋隆,插入片段平均長度大于1 kb.隨機挑取200箇剋隆,利用PCR方法測得文庫重組率達95%,48.95%的EST(Expressed Sequence Tag)沒有同源性,顯示瞭這些ESTs中能夠髮現新功能基因的可能性.與GeneBank Nr數據庫中已知功能基因有較高同源性的有97條ESTs,相關同源性的已知基因分彆參與基礎代謝與運輸、細胞構成、能量轉換、輔酶代謝與運輸、信號傳導、翻譯機翻譯後的脩飾摺疊等過程.這是第一次以痳瘋樹全植株為材料構建全長均一化cDNA文庫.
이마풍수근、경、협、화화과실위재료,사용DSN (duplex-specific nuclease)균일화기술여SMART(switching mechanism at 5' end of RNA transcript)건고기술상결합,구건료마풍수전식주균일화전장cDNA문고.경검측고용위1.4×106개극륭,삽입편단평균장도대우1 kb.수궤도취200개극륭,이용PCR방법측득문고중조솔체95%,48.95%적EST(Expressed Sequence Tag)몰유동원성,현시료저사ESTs중능구발현신공능기인적가능성.여GeneBank Nr수거고중이지공능기인유교고동원성적유97조ESTs,상관동원성적이지기인분별삼여기출대사여운수、세포구성、능량전환、보매대사여운수、신호전도、번역궤번역후적수식절첩등과정.저시제일차이마풍수전식주위재료구건전장균일화cDNA문고.