计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2011年
28期
237-240
,共4页
王常武%刘楠楠%贾永伟%王宝文%刘文远
王常武%劉楠楠%賈永偉%王寶文%劉文遠
왕상무%류남남%가영위%왕보문%류문원
癌症基因表达数据%双向聚类算法%贪婪迭代%覆盖矩阵%平均平方残基
癌癥基因錶達數據%雙嚮聚類算法%貪婪迭代%覆蓋矩陣%平均平方殘基
암증기인표체수거%쌍향취류산법%탐람질대%복개구진%평균평방잔기
癌症基因表达数据的聚类分析可以为癌症的早期诊断和精确的癌症亚型分型提供依据.针对癌症基因表达数据的特点,提出一种称为OMB(Override Matrix Bicluster)的双向聚类算法.OMB算法分别在基因表达数据矩阵的行和列上搜索低于阈值的行和列,用删除添加算法产生一个子矩阵；构建与基因表达矩阵大小相同的覆盖矩阵,标识矩阵中上一次迭代产生的子矩阵的位置；在标识出来的矩阵中,重复贪婪迭代搜索找到K个聚类结果.Matlab实验结果表明OMB算法对具有重叠结构的癌症基因表达数据具有更好的聚类效果.
癌癥基因錶達數據的聚類分析可以為癌癥的早期診斷和精確的癌癥亞型分型提供依據.針對癌癥基因錶達數據的特點,提齣一種稱為OMB(Override Matrix Bicluster)的雙嚮聚類算法.OMB算法分彆在基因錶達數據矩陣的行和列上搜索低于閾值的行和列,用刪除添加算法產生一箇子矩陣；構建與基因錶達矩陣大小相同的覆蓋矩陣,標識矩陣中上一次迭代產生的子矩陣的位置；在標識齣來的矩陣中,重複貪婪迭代搜索找到K箇聚類結果.Matlab實驗結果錶明OMB算法對具有重疊結構的癌癥基因錶達數據具有更好的聚類效果.
암증기인표체수거적취류분석가이위암증적조기진단화정학적암증아형분형제공의거.침대암증기인표체수거적특점,제출일충칭위OMB(Override Matrix Bicluster)적쌍향취류산법.OMB산법분별재기인표체수거구진적행화렬상수색저우역치적행화렬,용산제첨가산법산생일개자구진；구건여기인표체구진대소상동적복개구진,표식구진중상일차질대산생적자구진적위치；재표식출래적구진중,중복탐람질대수색조도K개취류결과.Matlab실험결과표명OMB산법대구유중첩결구적암증기인표체수거구유경호적취류효과.
