CAJ | 학술논문

运用RT-PCR技术克隆了水稻南方黑条矮缩病毒(southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)湖南鼎城株系的基因组S10片段(SRBSDV-HuNDC S10),并对其全序列进行了测定和生物信息学分析.结果显示,SRBSDV-HuNDC S10片段全长为1 797 bp (登录号:JQ337964),含有1个ORF,编码557个氨基酸残基的衣壳蛋白,推测分子量约62.6 kD,推测等电点为7.62,与已报道的广东、海南和云南分离物病毒的S10作比较,它们的核苷酸相似性分别为99.7%、99.0%和98.4%,氨基酸相似性分别为100.0%、99.5%和99.3%.对SRBSDV-HuNDC S10及部分Fijiviruses病毒对应片段在5' URT与3' URT存在的保守序列和互补序列进行了归纳,对其ORF编码的氨基酸序列进行了motif查找,得到该属(Fijiviruses)氨基酸序列的10个保守区段.此外,进行了糖基化位点、磷酸化位点及B细胞抗原表位预测,发现了3个可能的N端豆蔻酰基化位点,可能与病毒的侵染机制有关.
운용RT-PCR기술극륭료수도남방흑조왜축병독(southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)호남정성주계적기인조S10편단(SRBSDV-HuNDC S10),병대기전서렬진행료측정화생물신식학분석.결과현시,SRBSDV-HuNDC S10편단전장위1 797 bp (등록호:JQ337964),함유1개ORF,편마557개안기산잔기적의각단백,추측분자량약62.6 kD,추측등전점위7.62,여이보도적엄동、해남화운남분리물병독적S10작비교,타문적핵감산상사성분별위99.7%、99.0%화98.4%,안기산상사성분별위100.0%、99.5%화99.3%.대SRBSDV-HuNDC S10급부분Fijiviruses병독대응편단재5' URT여3' URT존재적보수서렬화호보서렬진행료귀납,대기ORF편마적안기산서렬진행료motif사조,득도해속(Fijiviruses)안기산서렬적10개보수구단.차외,진행료당기화위점、린산화위점급B세포항원표위예측,발현료3개가능적N단두구선기화위점,가능여병독적침염궤제유관.