基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2011年
6期
664-669
,共6页
刘吉平%王永宾%魏建影%辛锦兰
劉吉平%王永賓%魏建影%辛錦蘭
류길평%왕영빈%위건영%신금란
家蚕%BmNPV基因组%polyhedrin基因%PCR
傢蠶%BmNPV基因組%polyhedrin基因%PCR
가잠%BmNPV기인조%polyhedrin기인%PCR
为研究应用PCR技术进行家蚕核型多角体病毒广东株的敏感性检验以及探讨不同地理株系的基因水平的相互关系,本文通过对家蚕核型多角体病毒BmNPV广东株的人工繁殖与纯化,引用了一对根据多角体蛋白基因设计的引物phy35/phy36,对BmNPV的基因组模板DNA进行了PCR扩增,并对其产物进行测序分析.结果显示,PCR技术均可扩增检测出3×108个/mL至3×102个/mL不同浓度的BmNPV模板DNA,特异目标片段大小约为680 bp,且扩增带的亮度随着病毒液浓度的降低而减弱,说明应用引物phy35/phy36进行PCR方法可以有效地应用于检测BmNPV病毒感染的家蚕.同时,测序获得了BmNPV广东株多角体蛋白polyhedrin基因674 bp大小的片段,GC含量为46.4%.经过BLAST比对分析,与BmNPV泰国株的相似性为99%,暗示家蚕BmNPV广东株与泰国株的BmNPV (登录号AY779044)亲缘关系非常相近,两者可能属于BmNPV的不同地理株系.通过系统发育树的进一步分析发现,家蚕核型多角体病毒广东株polyhedrin基因部分序列与家蚕NPV分离株S9多角体蛋白基因(DQ231336)关系很近.
為研究應用PCR技術進行傢蠶覈型多角體病毒廣東株的敏感性檢驗以及探討不同地理株繫的基因水平的相互關繫,本文通過對傢蠶覈型多角體病毒BmNPV廣東株的人工繁殖與純化,引用瞭一對根據多角體蛋白基因設計的引物phy35/phy36,對BmNPV的基因組模闆DNA進行瞭PCR擴增,併對其產物進行測序分析.結果顯示,PCR技術均可擴增檢測齣3×108箇/mL至3×102箇/mL不同濃度的BmNPV模闆DNA,特異目標片段大小約為680 bp,且擴增帶的亮度隨著病毒液濃度的降低而減弱,說明應用引物phy35/phy36進行PCR方法可以有效地應用于檢測BmNPV病毒感染的傢蠶.同時,測序穫得瞭BmNPV廣東株多角體蛋白polyhedrin基因674 bp大小的片段,GC含量為46.4%.經過BLAST比對分析,與BmNPV泰國株的相似性為99%,暗示傢蠶BmNPV廣東株與泰國株的BmNPV (登錄號AY779044)親緣關繫非常相近,兩者可能屬于BmNPV的不同地理株繫.通過繫統髮育樹的進一步分析髮現,傢蠶覈型多角體病毒廣東株polyhedrin基因部分序列與傢蠶NPV分離株S9多角體蛋白基因(DQ231336)關繫很近.
위연구응용PCR기술진행가잠핵형다각체병독엄동주적민감성검험이급탐토불동지리주계적기인수평적상호관계,본문통과대가잠핵형다각체병독BmNPV엄동주적인공번식여순화,인용료일대근거다각체단백기인설계적인물phy35/phy36,대BmNPV적기인조모판DNA진행료PCR확증,병대기산물진행측서분석.결과현시,PCR기술균가확증검측출3×108개/mL지3×102개/mL불동농도적BmNPV모판DNA,특이목표편단대소약위680 bp,차확증대적량도수착병독액농도적강저이감약,설명응용인물phy35/phy36진행PCR방법가이유효지응용우검측BmNPV병독감염적가잠.동시,측서획득료BmNPV엄동주다각체단백polyhedrin기인674 bp대소적편단,GC함량위46.4%.경과BLAST비대분석,여BmNPV태국주적상사성위99%,암시가잠BmNPV엄동주여태국주적BmNPV (등록호AY779044)친연관계비상상근,량자가능속우BmNPV적불동지리주계.통과계통발육수적진일보분석발현,가잠핵형다각체병독엄동주polyhedrin기인부분서렬여가잠NPV분리주S9다각체단백기인(DQ231336)관계흔근.
