分子植物育种
分子植物育種
분자식물육충
MOLECULAR PLANT BREEDING
2011年
5期
592-598
,共7页
香蕉%抑制性消减杂交%体细胞胚
香蕉%抑製性消減雜交%體細胞胚
향초%억제성소감잡교%체세포배
本研究以野生蕉胚性悬浮系为材料,将胚性细胞增殖培养基上的香焦胚性悬浮系作为对照,体胚诱导培养基上的培养材料为处理,利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,构建野生蕉胚性悬浮系激素诱导的胚胎发育差异表达cDNA文库,随机挑选阳性克隆并进行生物信息学分析.结果显示,聚类得到62条非冗余EST.经Blast比对后发现其中18条没有对应功能的相似序列,46条在GenBank中有同源序列,其中12条为功能未知的基因.在文库中功能已知的ESTs中,这些基因涉及基础代谢(primary metabolism)、蛋白结合(protein binding)、转录(transport)细胞分化(cell differentiation)等功能.文库中发现了一些可能与体细胞胚胎发育相关的基因如TPD1基因、热激蛋白基因、谷胱甘肽-S-转移酶基因、锌指蛋白基因以及细胞壁富含羟脯氨酸糖蛋白基因等.试验结果为获得香焦体细胞胚胎发育相关基因全长并验证这些基因的功能提供依据.
本研究以野生蕉胚性懸浮繫為材料,將胚性細胞增殖培養基上的香焦胚性懸浮繫作為對照,體胚誘導培養基上的培養材料為處理,利用抑製性消減雜交(suppression subtractive hybridization,SSH)技術,構建野生蕉胚性懸浮繫激素誘導的胚胎髮育差異錶達cDNA文庫,隨機挑選暘性剋隆併進行生物信息學分析.結果顯示,聚類得到62條非冗餘EST.經Blast比對後髮現其中18條沒有對應功能的相似序列,46條在GenBank中有同源序列,其中12條為功能未知的基因.在文庫中功能已知的ESTs中,這些基因涉及基礎代謝(primary metabolism)、蛋白結閤(protein binding)、轉錄(transport)細胞分化(cell differentiation)等功能.文庫中髮現瞭一些可能與體細胞胚胎髮育相關的基因如TPD1基因、熱激蛋白基因、穀胱甘肽-S-轉移酶基因、鋅指蛋白基因以及細胞壁富含羥脯氨痠糖蛋白基因等.試驗結果為穫得香焦體細胞胚胎髮育相關基因全長併驗證這些基因的功能提供依據.
본연구이야생초배성현부계위재료,장배성세포증식배양기상적향초배성현부계작위대조,체배유도배양기상적배양재료위처리,이용억제성소감잡교(suppression subtractive hybridization,SSH)기술,구건야생초배성현부계격소유도적배태발육차이표체cDNA문고,수궤도선양성극륭병진행생물신식학분석.결과현시,취류득도62조비용여EST.경Blast비대후발현기중18조몰유대응공능적상사서렬,46조재GenBank중유동원서렬,기중12조위공능미지적기인.재문고중공능이지적ESTs중,저사기인섭급기출대사(primary metabolism)、단백결합(protein binding)、전록(transport)세포분화(cell differentiation)등공능.문고중발현료일사가능여체세포배태발육상관적기인여TPD1기인、열격단백기인、곡광감태-S-전이매기인、자지단백기인이급세포벽부함간포안산당단백기인등.시험결과위획득향초체세포배태발육상관기인전장병험증저사기인적공능제공의거.
