生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2006年
3期
254-261
,共8页
王士雷%黄波%周云%孙之荣
王士雷%黃波%週雲%孫之榮
왕사뢰%황파%주운%손지영
转录因子%转录调控%基因表达谱%ChIP-chip实验%模式
轉錄因子%轉錄調控%基因錶達譜%ChIP-chip實驗%模式
전록인자%전록조공%기인표체보%ChIP-chip실험%모식
为了对肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的分子发病机理进行研究,首先对肝癌基因表达谱数据用t-检验算法进行了分析,找到了肝癌中特异性表达基因(characteristic genes).然后把这些基因结合已知的肝HNF家族转录因子染色质免疫共沉淀结合DNA启动子芯片(ChIP-chip)实验数据用SAEM算法进行分析,得到了肝癌特异性表达基因的转录调控关系,并寻找到了多个HNF家族转录因子调控单基因的转录调控模式.结果表明HNF家族转录因子对大量具有重要功能的肝癌特异性表达基因进行了转录调控,并且多个HNF家族转录因子调控单基因可以形成前馈环和多输入调控等模式.
為瞭對肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的分子髮病機理進行研究,首先對肝癌基因錶達譜數據用t-檢驗算法進行瞭分析,找到瞭肝癌中特異性錶達基因(characteristic genes).然後把這些基因結閤已知的肝HNF傢族轉錄因子染色質免疫共沉澱結閤DNA啟動子芯片(ChIP-chip)實驗數據用SAEM算法進行分析,得到瞭肝癌特異性錶達基因的轉錄調控關繫,併尋找到瞭多箇HNF傢族轉錄因子調控單基因的轉錄調控模式.結果錶明HNF傢族轉錄因子對大量具有重要功能的肝癌特異性錶達基因進行瞭轉錄調控,併且多箇HNF傢族轉錄因子調控單基因可以形成前饋環和多輸入調控等模式.
위료대간암(hepatocellular carcinoma,HCC)적분자발병궤리진행연구,수선대간암기인표체보수거용t-검험산법진행료분석,조도료간암중특이성표체기인(characteristic genes).연후파저사기인결합이지적간HNF가족전록인자염색질면역공침정결합DNA계동자심편(ChIP-chip)실험수거용SAEM산법진행분석,득도료간암특이성표체기인적전록조공관계,병심조도료다개HNF가족전록인자조공단기인적전록조공모식.결과표명HNF가족전록인자대대량구유중요공능적간암특이성표체기인진행료전록조공,병차다개HNF가족전록인자조공단기인가이형성전궤배화다수입조공등모식.
