四川农业大学学报
四川農業大學學報
사천농업대학학보
JOURNAL OF SICHUAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2008年
4期
385-392
,共8页
伍碧华%路洁霏%胡喜贵%李平%颜泽洪%刘登才%郑有良
伍碧華%路潔霏%鬍喜貴%李平%顏澤洪%劉登纔%鄭有良
오벽화%로길비%호희귀%리평%안택홍%류등재%정유량
野生二粒小麦%低分子量谷蛋白%基因克隆%序列分析%二级结构
野生二粒小麥%低分子量穀蛋白%基因剋隆%序列分析%二級結構
야생이립소맥%저분자량곡단백%기인극륭%서렬분석%이급결구
根据低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)基因编码区保守序列设计引物,用PCR方法从蛋白质含量低至13.17%的D81和高达27.20%的D42 2份野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)中克隆得到2个LMW-GS基因序列LMW-D81和LMW-D42(GenBank 上的序列号分别为FJ461691和FJ461690).它们具有小麦低分子量谷蛋白基因的典型结构特征,其长度分别为1053bp和1011bp,并分别编码350和336个氨基酸残基的成熟蛋白.LMW-D42和LMW-D81的氨基酸序列估算分子量分别为38kDa和39kDa,说明二者均为C型亚基编码基因.LMW-D42和LMW-D81的N-末端序列都为METSHIP-,表明这2个C型亚基编码基因归属LMW-m型.同源性比对和聚类分析揭示,LMW-D81和LMW-D42均属于Glu-B3位点编码基因.LMW-D42和LMW-D81的核苷酸序列和推导的氨基酸序列一致性分别为93.94%和92.57%.与LMW-D81相比,LMW-D42除发生了22处间断性的碱基替换外,还存在一段42个碱基的缺失.对推导氨基酸序列进行的二级结构预测显示,LMW-D81和LMW-D42的蛋白质二级结构高度一致.其α-螺旋主要位于信号肽和C-末端,少量的α-螺旋和不规则卷曲构成了N-末端.大多数不规则卷曲位于重复区,仅有的一段β-折叠则出现在C-末端.同时,它们的编码区均具有分布一致的8个半胱氨酸残基,且第一和第七个半胱氨酸残基均位于无规则卷曲中.这些结构特点对小麦加工品质改良具有一定意义.
根據低分子量穀蛋白亞基(LMW-GS)基因編碼區保守序列設計引物,用PCR方法從蛋白質含量低至13.17%的D81和高達27.20%的D42 2份野生二粒小麥(Triticum dicoccoides)中剋隆得到2箇LMW-GS基因序列LMW-D81和LMW-D42(GenBank 上的序列號分彆為FJ461691和FJ461690).它們具有小麥低分子量穀蛋白基因的典型結構特徵,其長度分彆為1053bp和1011bp,併分彆編碼350和336箇氨基痠殘基的成熟蛋白.LMW-D42和LMW-D81的氨基痠序列估算分子量分彆為38kDa和39kDa,說明二者均為C型亞基編碼基因.LMW-D42和LMW-D81的N-末耑序列都為METSHIP-,錶明這2箇C型亞基編碼基因歸屬LMW-m型.同源性比對和聚類分析揭示,LMW-D81和LMW-D42均屬于Glu-B3位點編碼基因.LMW-D42和LMW-D81的覈苷痠序列和推導的氨基痠序列一緻性分彆為93.94%和92.57%.與LMW-D81相比,LMW-D42除髮生瞭22處間斷性的堿基替換外,還存在一段42箇堿基的缺失.對推導氨基痠序列進行的二級結構預測顯示,LMW-D81和LMW-D42的蛋白質二級結構高度一緻.其α-螺鏇主要位于信號肽和C-末耑,少量的α-螺鏇和不規則捲麯構成瞭N-末耑.大多數不規則捲麯位于重複區,僅有的一段β-摺疊則齣現在C-末耑.同時,它們的編碼區均具有分佈一緻的8箇半胱氨痠殘基,且第一和第七箇半胱氨痠殘基均位于無規則捲麯中.這些結構特點對小麥加工品質改良具有一定意義.
근거저분자량곡단백아기(LMW-GS)기인편마구보수서렬설계인물,용PCR방법종단백질함량저지13.17%적D81화고체27.20%적D42 2빈야생이립소맥(Triticum dicoccoides)중극륭득도2개LMW-GS기인서렬LMW-D81화LMW-D42(GenBank 상적서렬호분별위FJ461691화FJ461690).타문구유소맥저분자량곡단백기인적전형결구특정,기장도분별위1053bp화1011bp,병분별편마350화336개안기산잔기적성숙단백.LMW-D42화LMW-D81적안기산서렬고산분자량분별위38kDa화39kDa,설명이자균위C형아기편마기인.LMW-D42화LMW-D81적N-말단서렬도위METSHIP-,표명저2개C형아기편마기인귀속LMW-m형.동원성비대화취류분석게시,LMW-D81화LMW-D42균속우Glu-B3위점편마기인.LMW-D42화LMW-D81적핵감산서렬화추도적안기산서렬일치성분별위93.94%화92.57%.여LMW-D81상비,LMW-D42제발생료22처간단성적감기체환외,환존재일단42개감기적결실.대추도안기산서렬진행적이급결구예측현시,LMW-D81화LMW-D42적단백질이급결구고도일치.기α-라선주요위우신호태화C-말단,소량적α-라선화불규칙권곡구성료N-말단.대다수불규칙권곡위우중복구,부유적일단β-절첩칙출현재C-말단.동시,타문적편마구균구유분포일치적8개반광안산잔기,차제일화제칠개반광안산잔기균위우무규칙권곡중.저사결구특점대소맥가공품질개량구유일정의의.