CAJ | 학술논문

目的研究我国人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)B'亚型主要流行株在宿主免疫压力下的基因变异及抗原表位的变化特征,探讨选择压力、基因离散率和抗原表位变化之间的关系.方法从确诊的HIV-1感染者的全血样本中提取基因组DNA,经套式聚合酶链反应(PCR)扩增后,将扩增产物进行纯化和测序.然后将所得序列进行系统进化树和氨基酸变异分析,使用GCG软件包的Distance程序对P17和P24两个区段计算基因距离,用Diverge程序计算同义替换(Ks)和非同义替换(Ka)及二者之间的比值,并对我国人群中较常见的HLA型别限制的CTL表位的突变情况进行分析.结果 HIV-1 B'亚型毒株的P17区段的Ks/Ka值＜1,而P24区段的Ks/Ka值＞1;P24部分的基因离散率低于P17部分;P17区段抗原表位的保守率为34.94%,而P24区段抗原表位的保守率为67.38%;从基因离散率、所受的选择压力及抗原表位的突变率3个方面来看,HIV-1的P17区段均明显大于P24区段.结论 HIV-1 B'亚型毒株的P17区段的抗原表位变化较大,而P24区段的抗原表位相对较为保守.提示P24区段的CTL表位更适合于表位疫苗的研制.
목적 연구아국인면역결함병독1형(HIV-1)B'아형주요류행주재숙주면역압력하적기인변이급항원표위적변화특정,탐토선택압력、기인리산솔화항원표위변화지간적관계.방법 종학진적HIV-1감염자적전혈양본중제취기인조DNA,경투식취합매련반응(PCR)확증후,장확증산물진행순화화측서.연후장소득서렬진행계통진화수화안기산변이분석,사용GCG연건포적Distance정서대P17화P24량개구단계산기인거리,용Diverge정서계산동의체환(Ks)화비동의체환(Ka)급이자지간적비치,병대아국인군중교상견적HLA형별한제적CTL표위적돌변정황진행분석.결과 HIV-1 B'아형독주적P17구단적Ks/Ka치＜1,이P24구단적Ks/Ka치＞1;P24부분적기인리산솔저우P17부분;P17구단항원표위적보수솔위34.94%,이P24구단항원표위적보수솔위67.38%;종기인리산솔、소수적선택압력급항원표위적돌변솔3개방면래간,HIV-1적P17구단균명현대우P24구단.결론 HIV-1 B'아형독주적P17구단적항원표위변화교대,이P24구단적항원표위상대교위보수.제시P24구단적CTL표위경괄합우표위역묘적연제.