SARS冠状病毒S基因序列及细胞抗原表位预测
SARS관상병독S기인서렬급세포항원표위예측
Comparison of S genome sequence of SARS- CoV and prediction of B cell epitopes
  • 万方数据
    中国公共卫生 중국공공위생
    CHINA PUBLIC HEALTH
    2004年 8期 919-920 ,共2页

    何凡%郭新雄%赵卫%龙北国%江丽芳%张文炳%晏辉钧%胡族琼

    하범%곽신웅%조위%룡북국%강려방%장문병%안휘균%호족경

    SARS%S蛋白%抗原表位%冠状病毒 SARS%S蛋白%抗原錶位%冠狀病毒
    SARS%S단백%항원표위%관상병독
    目的比较SARS冠状病毒各分离株S基因序列及氨基酸序列之间的差异,预测SARS-CoV的S蛋白的抗原表位.方法利用Lasergene软件包中的EditSeq从21株SARS冠状病毒分离株截取S基因序列并翻译成氨基酸序列,然后用ClustalX软件对截取序列进行比较分析,确定基准株,最后用Protean软件对基准株进行抗原表位预测.结果在21株分离株的S基因中有8株核苷酸序列、13株氨基酸序列没有发生点突变;预测出78个可能性抗原表位.结论SARS-CoV的S蛋白相当保守,只发生个别点突变,可能性抗原表位多,且在其中的14个区域中可能性最显著.
    목적비교SARS관상병독각분리주S기인서렬급안기산서렬지간적차이,예측SARS-CoV적S단백적항원표위.방법이용Lasergene연건포중적EditSeq종21주SARS관상병독분리주절취S기인서렬병번역성안기산서렬,연후용ClustalX연건대절취서렬진행비교분석,학정기준주,최후용Protean연건대기준주진행항원표위예측.결과재21주분리주적S기인중유8주핵감산서렬、13주안기산서렬몰유발생점돌변;예측출78개가능성항원표위.결론SARS-CoV적S단백상당보수,지발생개별점돌변,가능성항원표위다,차재기중적14개구역중가능성최현저.
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