湖南农业科学
湖南農業科學
호남농업과학
HUNAN AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
9期
10-13
,共4页
郝建华%刘均忠%王芳%纪晓峰%孙谧
郝建華%劉均忠%王芳%紀曉峰%孫謐
학건화%류균충%왕방%기효봉%손밀
海洋假单胞杆菌%基因组文库%序列分析
海洋假單胞桿菌%基因組文庫%序列分析
해양가단포간균%기인조문고%서렬분석
通过超声波处理HW08基因组,将获得的1～2KB DNA片段与pUC18质粒进行连接后转化,构建文库.随机筛选200个克隆进行序列测定,快速分析了海洋假单胞杆茵HW08基因组.结果表明:构建了HW08菌株的基因组部分文库,获得序列173个,包含7个载体序列和7个重叠群,其中最长重叠群为重叠群4,包含3段基因序列,分别为Chemotaxis Protein、Hypothetical protein和LacI family transcription regulator.重叠群3为DNA修复蛋白,其最大相似性为83％.166个序列中酶类占绝大部分,同时也包含37个新基因.
通過超聲波處理HW08基因組,將穫得的1～2KB DNA片段與pUC18質粒進行連接後轉化,構建文庫.隨機篩選200箇剋隆進行序列測定,快速分析瞭海洋假單胞桿茵HW08基因組.結果錶明:構建瞭HW08菌株的基因組部分文庫,穫得序列173箇,包含7箇載體序列和7箇重疊群,其中最長重疊群為重疊群4,包含3段基因序列,分彆為Chemotaxis Protein、Hypothetical protein和LacI family transcription regulator.重疊群3為DNA脩複蛋白,其最大相似性為83％.166箇序列中酶類佔絕大部分,同時也包含37箇新基因.
통과초성파처리HW08기인조,장획득적1～2KB DNA편단여pUC18질립진행련접후전화,구건문고.수궤사선200개극륭진행서렬측정,쾌속분석료해양가단포간인HW08기인조.결과표명:구건료HW08균주적기인조부분문고,획득서렬173개,포함7개재체서렬화7개중첩군,기중최장중첩군위중첩군4,포함3단기인서렬,분별위Chemotaxis Protein、Hypothetical protein화LacI family transcription regulator.중첩군3위DNA수복단백,기최대상사성위83％.166개서렬중매류점절대부분,동시야포함37개신기인.
