CAJ | 학술논문

为建立口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)不同血清型与基因型的基因芯片检测方法,设计针对O型8个基因型、A型3个基因型和亚洲1型的特异性探针.从美国GenBank与英国世界口蹄疫参考实验室基因库下载了O型、A型和亚洲1型FMDV的VP1基因序列547条.对每一血清型序列用DNA Star软件ClastalW程序进行多重比对,做系统发育分析并进行基因分型.用生物学软件Bio Sun 2.0建立基因型数据库,设计每一基因型的特异性探针.共设计出104条候选探针,通过芯片试验筛选出12条特异性探针.以各型特异性探针所对应的靶序列模板做10倍系列稀释进行PCR扩增,扩增产物与探针杂交,验证各探针的灵敏度.对O型SEA、Euro-SA、ME-SA、WA 4个基因型的各条探针的灵敏度进行了检验,结果这些探针能够检测到102数量级拷贝数的阳性靶标.
위건립구제역병독(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)불동혈청형여기인형적기인심편검측방법,설계침대O형8개기인형、A형3개기인형화아주1형적특이성탐침.종미국GenBank여영국세계구제역삼고실험실기인고하재료O형、A형화아주1형FMDV적VP1기인서렬547조.대매일혈청형서렬용DNA Star연건ClastalW정서진행다중비대,주계통발육분석병진행기인분형.용생물학연건Bio Sun 2.0건립기인형수거고,설계매일기인형적특이성탐침.공설계출104조후선탐침,통과심편시험사선출12조특이성탐침.이각형특이성탐침소대응적파서렬모판주10배계렬희석진행PCR확증,확증산물여탐침잡교,험증각탐침적령민도.대O형SEA、Euro-SA、ME-SA、WA 4개기인형적각조탐침적령민도진행료검험,결과저사탐침능구검측도102수량급고패수적양성파표.