生命科学研究
生命科學研究
생명과학연구
LIFE SCIENCE RESEARCH
2010年
6期
485-491
,共7页
李柯%阴环%奚耕思%廉振民
李柯%陰環%奚耕思%廉振民
리가%음배%해경사%렴진민
粘虫%甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因%克隆
粘蟲%甘油醛-3-燐痠脫氫酶基因%剋隆
점충%감유철-3-린산탈경매기인%극륭
运用RT-PCR和RACE技术,以粘虫(Mythimna separata(Walker))cDNA为模板,对甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-Phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因进行克隆获得全长cDNA序列,并利用生物信息学方法,对GAPDH全长cDNA序列及推测得到的GAPDH蛋白序列进行分析.结果表明,获得的粘虫GAPDH基因cDNA序列长度为1 317 bp,其中包括80 bp的5'非编码区、238 bp的3'非编码区和999 bp的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),编码一个332个氨基酸蛋白,具有GAPDH蛋白家族的两个功能结构域.该GAPDH蛋白理论相对分子质量为35.498 6 kDa,等电点为7.63,富含6种类型的特定功能位点.该蛋白序列与其他动物GAPDH蛋白序列具有77.4%～92.9%高度同源性.GAPDH基因表达量检测结果显示GAPDH在粘虫6种不同组织间表达量无显著差异(P＞0.05),表明GAPDH可作为研究粘虫功能基因表达量分析的可靠内参基因.该基因的cDNA序列已经递交GenBank并获得登录号为HM055756.
運用RT-PCR和RACE技術,以粘蟲(Mythimna separata(Walker))cDNA為模闆,對甘油醛-3-燐痠脫氫酶(glyceraldehyde-3-Phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因進行剋隆穫得全長cDNA序列,併利用生物信息學方法,對GAPDH全長cDNA序列及推測得到的GAPDH蛋白序列進行分析.結果錶明,穫得的粘蟲GAPDH基因cDNA序列長度為1 317 bp,其中包括80 bp的5'非編碼區、238 bp的3'非編碼區和999 bp的開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF),編碼一箇332箇氨基痠蛋白,具有GAPDH蛋白傢族的兩箇功能結構域.該GAPDH蛋白理論相對分子質量為35.498 6 kDa,等電點為7.63,富含6種類型的特定功能位點.該蛋白序列與其他動物GAPDH蛋白序列具有77.4%～92.9%高度同源性.GAPDH基因錶達量檢測結果顯示GAPDH在粘蟲6種不同組織間錶達量無顯著差異(P＞0.05),錶明GAPDH可作為研究粘蟲功能基因錶達量分析的可靠內參基因.該基因的cDNA序列已經遞交GenBank併穫得登錄號為HM055756.
운용RT-PCR화RACE기술,이점충(Mythimna separata(Walker))cDNA위모판,대감유철-3-린산탈경매(glyceraldehyde-3-Phosphate dehydrogenase,GAPDH)기인진행극륭획득전장cDNA서렬,병이용생물신식학방법,대GAPDH전장cDNA서렬급추측득도적GAPDH단백서렬진행분석.결과표명,획득적점충GAPDH기인cDNA서렬장도위1 317 bp,기중포괄80 bp적5'비편마구、238 bp적3'비편마구화999 bp적개방열독광(Open Reading Frame,ORF),편마일개332개안기산단백,구유GAPDH단백가족적량개공능결구역.해GAPDH단백이론상대분자질량위35.498 6 kDa,등전점위7.63,부함6충류형적특정공능위점.해단백서렬여기타동물GAPDH단백서렬구유77.4%～92.9%고도동원성.GAPDH기인표체량검측결과현시GAPDH재점충6충불동조직간표체량무현저차이(P＞0.05),표명GAPDH가작위연구점충공능기인표체량분석적가고내삼기인.해기인적cDNA서렬이경체교GenBank병획득등록호위HM055756.
