CAJ | 학술논문

利用基因组序列比对分析等生物信息学方法发掘肠球菌新的属特异性靶点,根据42个候选靶点序列设计50对引物,结合普通PCR初筛和荧光定量PCR复筛,挑选特异性和灵敏度等检测性能最佳的引物,建立相应的荧光定量PCR检测方法,并对该方法应用于食品中肠球菌检测时的效果作出评价.分析结果显示,特异性最强的引物为EF1902,利用该引物建立的荧光定量体系检测肠球菌时均产生特异性扩增信号,而检测非肠球菌菌株时均无特异性扩增信号形成.经优化PCR体系后,该方法的基因组DNA检测灵敏度为13.78拷贝/PCR,纯培养物灵敏度为38.4 cfu/PCR.以肠球菌人工污染牛奶,当初始接菌量为2.63 cfu/mL时,只需增菌6 h即可用该方法检出肠球菌.对52份食品样品进行检测准确率为94.23％,证实了该方法可应用于食源性肠球菌的快速检测.综上所述,作者建立的肠球菌荧光定量PCR方法,特异性强且灵敏度高,可应用于食品中肠球菌的快速检测.
이용기인조서렬비대분석등생물신식학방법발굴장구균신적속특이성파점,근거42개후선파점서렬설계50대인물,결합보통PCR초사화형광정량PCR복사,도선특이성화령민도등검측성능최가적인물,건립상응적형광정량PCR검측방법,병대해방법응용우식품중장구균검측시적효과작출평개.분석결과현시,특이성최강적인물위EF1902,이용해인물건립적형광정량체계검측장구균시균산생특이성확증신호,이검측비장구균균주시균무특이성확증신호형성.경우화PCR체계후,해방법적기인조DNA검측령민도위13.78고패/PCR,순배양물령민도위38.4 cfu/PCR.이장구균인공오염우내,당초시접균량위2.63 cfu/mL시,지수증균6 h즉가용해방법검출장구균.대52빈식품양품진행검측준학솔위94.23％,증실료해방법가응용우식원성장구균적쾌속검측.종상소술,작자건립적장구균형광정량PCR방법,특이성강차령민도고,가응용우식품중장구균적쾌속검측.