生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2005年
3期
268-274
,共7页
类LSD1基因,锌指结构域,细胞程序化死亡(PCD),系统发生,基因复制
類LSD1基因,鋅指結構域,細胞程序化死亡(PCD),繫統髮生,基因複製
류LSD1기인,자지결구역,세포정서화사망(PCD),계통발생,기인복제
类LSD1 (LSD1-like)基因家族是一类特殊的C2C2型锌指蛋白基因,编码植物特有的转录因子.目前已经研究的2个成员拟南芥LSD1(1esions stimulating disease resistance 1)和LOL1(LSD-One-Like 1)基因均参与植物细胞程序化死亡(programmed cell death,PCD)的调控.从水稻cDNA文库中克隆到1个类LSD1基因,命名为OsLSD1.该基因长988 bp,包含一个432bp的开放阅读框,推导的氨基酸序列(143个氨基酸)含有3个内部保守的锌指结构域.DNA印迹结果表明OsLSD1基因在水稻基因组中为单拷贝,且在根、茎和叶中表达.借助于生物信息学分析技术,从拟南芥和水稻数据库中各识别出5个和7个(包括OsLSD1)类LSD1基因.分析了这些类LSD1基因的结构,蛋白质结构域组成.系统进化分析表明,无论基于编码区的核苷酸或氨基酸序列都可以将这些类LSD1基因分为2类.虽然不存在拟南芥或水稻特有的类LSD1蛋白,但有些结构域是水稻所特有的,也有些基因是来源于复制事件.
類LSD1 (LSD1-like)基因傢族是一類特殊的C2C2型鋅指蛋白基因,編碼植物特有的轉錄因子.目前已經研究的2箇成員擬南芥LSD1(1esions stimulating disease resistance 1)和LOL1(LSD-One-Like 1)基因均參與植物細胞程序化死亡(programmed cell death,PCD)的調控.從水稻cDNA文庫中剋隆到1箇類LSD1基因,命名為OsLSD1.該基因長988 bp,包含一箇432bp的開放閱讀框,推導的氨基痠序列(143箇氨基痠)含有3箇內部保守的鋅指結構域.DNA印跡結果錶明OsLSD1基因在水稻基因組中為單拷貝,且在根、莖和葉中錶達.藉助于生物信息學分析技術,從擬南芥和水稻數據庫中各識彆齣5箇和7箇(包括OsLSD1)類LSD1基因.分析瞭這些類LSD1基因的結構,蛋白質結構域組成.繫統進化分析錶明,無論基于編碼區的覈苷痠或氨基痠序列都可以將這些類LSD1基因分為2類.雖然不存在擬南芥或水稻特有的類LSD1蛋白,但有些結構域是水稻所特有的,也有些基因是來源于複製事件.
류LSD1 (LSD1-like)기인가족시일류특수적C2C2형자지단백기인,편마식물특유적전록인자.목전이경연구적2개성원의남개LSD1(1esions stimulating disease resistance 1)화LOL1(LSD-One-Like 1)기인균삼여식물세포정서화사망(programmed cell death,PCD)적조공.종수도cDNA문고중극륭도1개류LSD1기인,명명위OsLSD1.해기인장988 bp,포함일개432bp적개방열독광,추도적안기산서렬(143개안기산)함유3개내부보수적자지결구역.DNA인적결과표명OsLSD1기인재수도기인조중위단고패,차재근、경화협중표체.차조우생물신식학분석기술,종의남개화수도수거고중각식별출5개화7개(포괄OsLSD1)류LSD1기인.분석료저사류LSD1기인적결구,단백질결구역조성.계통진화분석표명,무론기우편마구적핵감산혹안기산서렬도가이장저사류LSD1기인분위2류.수연불존재의남개혹수도특유적류LSD1단백,단유사결구역시수도소특유적,야유사기인시래원우복제사건.
