CAJ | 학술논문

为了进一步了解新成人腹泻轮状病毒J19株的基因和蛋白特征,利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株的11个基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序.在此基础上,将主要抗原蛋白VP4、VP6和VP7的蛋白序列与其它轮状病毒的相关蛋白序列进行比较分析并对VP6蛋白序列做遗传进化分析.结果获得J19株11个基因的全长基因序列.基因序列分析表明J19株的第3、6和第9基因分别长2 512bp、1 287bp和820bp,它们分别预测编码抗原蛋白VP4(823aa)、VP6(396aa)和VP7(258aa).组成J19株的VP4、VP6和VP7蛋白序列对B组轮状病毒的CAL株、IDIR株以及ADRV株的相关蛋白序列的一致性分别是27.6%、38.5%和22.3%.对分组抗原蛋白VP6的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置靠近外群蛋白分支以及A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支.J19株的VP4、VP6和VP7蛋白序列与其它轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异.VP6蛋白序列的遗传进化分析表明J19株可能是一个新组轮状病毒的代表性毒株;同时,它也可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一.关于新成人腹泻轮状病毒J19株11个基因的克隆及VP4、VP6和VP7基因的序列分析,这是第一次报道.
위료진일보료해신성인복사륜상병독J19주적기인화단백특정,이용일충개량적비의뢰핵산서렬적단인물확증방법확증J19주적11개기인,극륭도pMD18-T재체중병진행측서.재차기출상,장주요항원단백VP4、VP6화VP7적단백서렬여기타륜상병독적상관단백서렬진행비교분석병대VP6단백서렬주유전진화분석.결과획득J19주11개기인적전장기인서렬.기인서렬분석표명J19주적제3、6화제9기인분별장2 512bp、1 287bp화820bp,타문분별예측편마항원단백VP4(823aa)、VP6(396aa)화VP7(258aa).조성J19주적VP4、VP6화VP7단백서렬대B조륜상병독적CAL주、IDIR주이급ADRV주적상관단백서렬적일치성분별시27.6%、38.5%화22.3%.대분조항원단백VP6적유전진화분석표명,J19주재진화수상적위치고근외군단백분지이급A、B화C조륜상병독분지적근부,이차타비교편향우B조륜상병독적분지.J19주적VP4、VP6화VP7단백서렬여기타륜상병독적상응단백서렬존재현저차이.VP6단백서렬적유전진화분석표명J19주가능시일개신조륜상병독적대표성독주;동시,타야가능시일개여B조륜상병독적기원화진화밀절상관적독주지일.관우신성인복사륜상병독J19주11개기인적극륭급VP4、VP6화VP7기인적서렬분석,저시제일차보도.