浙江农业学报
浙江農業學報
절강농업학보
ACTA AGRICULTURAE ZHEJIANGENSIS
2010年
6期
722-726
,共5页
刘建新%张智%丁华侨%葛亚英%王炜勇
劉建新%張智%丁華僑%葛亞英%王煒勇
류건신%장지%정화교%갈아영%왕위용
擎天凤梨%GAPDH%克隆
擎天鳳梨%GAPDH%剋隆
경천봉리%GAPDH%극륭
管家基因GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)常被用作定量、半定量PCR试验的内参,以确定目标基因的相对表达量.基于前期从全长cDNA文库中获得GAPDH基因的EST单克隆,进行PrimerWalking测序,获得一个GAPDH的全长cDNA序列,序列长1 790 bp,编码421个蛋白氨基酸,命名为GoGAP-DH1.采用Blast,ExPASy,ProtParam,SPOMA,Find Conserved Domains(NCBI),ClustalX,MEGA等生物信息学软件对cDNA序列、氨基酸序列、保守区、亲缘关系等特征进行分析.结果表明,GoGAPDH1与玉米的细胞质GAPDH基因源性最高,为82%.初步推断GoGAPDH1可能是一个胞质型GAPDH.
管傢基因GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)常被用作定量、半定量PCR試驗的內參,以確定目標基因的相對錶達量.基于前期從全長cDNA文庫中穫得GAPDH基因的EST單剋隆,進行PrimerWalking測序,穫得一箇GAPDH的全長cDNA序列,序列長1 790 bp,編碼421箇蛋白氨基痠,命名為GoGAP-DH1.採用Blast,ExPASy,ProtParam,SPOMA,Find Conserved Domains(NCBI),ClustalX,MEGA等生物信息學軟件對cDNA序列、氨基痠序列、保守區、親緣關繫等特徵進行分析.結果錶明,GoGAPDH1與玉米的細胞質GAPDH基因源性最高,為82%.初步推斷GoGAPDH1可能是一箇胞質型GAPDH.
관가기인GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)상피용작정량、반정량PCR시험적내삼,이학정목표기인적상대표체량.기우전기종전장cDNA문고중획득GAPDH기인적EST단극륭,진행PrimerWalking측서,획득일개GAPDH적전장cDNA서렬,서렬장1 790 bp,편마421개단백안기산,명명위GoGAP-DH1.채용Blast,ExPASy,ProtParam,SPOMA,Find Conserved Domains(NCBI),ClustalX,MEGA등생물신식학연건대cDNA서렬、안기산서렬、보수구、친연관계등특정진행분석.결과표명,GoGAPDH1여옥미적세포질GAPDH기인원성최고,위82%.초보추단GoGAPDH1가능시일개포질형GAPDH.