分析测试学报
分析測試學報
분석측시학보
JOURNAL OF INSTRUMENTAL ANALYSIS
2011年
3期
336-339
,共4页
徐容%吴再珍%郭莉萍%鲁辉%葛芝莉%谢洪平
徐容%吳再珍%郭莉萍%魯輝%葛芝莉%謝洪平
서용%오재진%곽리평%로휘%갈지리%사홍평
短串联重复序列%紫外光谱%支持向量机%基因分型
短串聯重複序列%紫外光譜%支持嚮量機%基因分型
단천련중복서렬%자외광보%지지향량궤%기인분형
利用紫外光谱结合支持向量机(SVM)模式识别原理建立了短串联重复序列(STR)的分型方法.以D5S818基因座的10-10、11-13和13-13三个基因型为研究对象,优化了包含该多态性位点的DNA片段的聚合酶链反应(PCR)的扩增条件和紫外光谱检测条件,获得了优化条件下的待测样本紫外光谱.以该光谱为识别变量,建立了该3类基因型的SVM判别模型,有效地克服了光谱共线性,模型预测率100%.该方法无需任何检测前处理,只需一步PCR扩增和紫外光谱检测即可实现STR的基凶分型,具有简单、快速、低成本等优点.
利用紫外光譜結閤支持嚮量機(SVM)模式識彆原理建立瞭短串聯重複序列(STR)的分型方法.以D5S818基因座的10-10、11-13和13-13三箇基因型為研究對象,優化瞭包含該多態性位點的DNA片段的聚閤酶鏈反應(PCR)的擴增條件和紫外光譜檢測條件,穫得瞭優化條件下的待測樣本紫外光譜.以該光譜為識彆變量,建立瞭該3類基因型的SVM判彆模型,有效地剋服瞭光譜共線性,模型預測率100%.該方法無需任何檢測前處理,隻需一步PCR擴增和紫外光譜檢測即可實現STR的基兇分型,具有簡單、快速、低成本等優點.
이용자외광보결합지지향량궤(SVM)모식식별원리건립료단천련중복서렬(STR)적분형방법.이D5S818기인좌적10-10、11-13화13-13삼개기인형위연구대상,우화료포함해다태성위점적DNA편단적취합매련반응(PCR)적확증조건화자외광보검측조건,획득료우화조건하적대측양본자외광보.이해광보위식별변량,건립료해3류기인형적SVM판별모형,유효지극복료광보공선성,모형예측솔100%.해방법무수임하검측전처리,지수일보PCR확증화자외광보검측즉가실현STR적기흉분형,구유간단、쾌속、저성본등우점.
