计算机应用研究
計算機應用研究
계산궤응용연구
APPLICATION RESEARCH OF COMPUTERS
2008年
3期
718-720
,共3页
分子动力学%并行算法%原子分解法%MPI_Allgather%邻居交换算法%非阻塞通信
分子動力學%併行算法%原子分解法%MPI_Allgather%鄰居交換算法%非阻塞通信
분자동역학%병행산법%원자분해법%MPI_Allgather%린거교환산법%비조새통신
比较了小型机群中模拟小规模粒子系统采用原子分解和区域分解算法的模拟时间.针对原子分解算法,优化了各进程粒子的受力计算,尤其对严重影响并行效率的全局通信进行了优化,最终使得并行效率提高了30%以上.使用该优化算法对固态氩的导热系数进行了计算,模拟结果与实验值比较吻合,大大缩短了时间.
比較瞭小型機群中模擬小規模粒子繫統採用原子分解和區域分解算法的模擬時間.針對原子分解算法,優化瞭各進程粒子的受力計算,尤其對嚴重影響併行效率的全跼通信進行瞭優化,最終使得併行效率提高瞭30%以上.使用該優化算法對固態氬的導熱繫數進行瞭計算,模擬結果與實驗值比較吻閤,大大縮短瞭時間.
비교료소형궤군중모의소규모입자계통채용원자분해화구역분해산법적모의시간.침대원자분해산법,우화료각진정입자적수력계산,우기대엄중영향병행효솔적전국통신진행료우화,최종사득병행효솔제고료30%이상.사용해우화산법대고태아적도열계수진행료계산,모의결과여실험치비교문합,대대축단료시간.